RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.52■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF1BO60333 1816 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 LTKP29376 864 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 RGL3Q3MIN7 710 aa22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 EID1Q9Y6B2 187 aa22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 SLIT1O75093 1534 aa22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 TONSLQ96HA7 1378 aa22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.45■■□□□ 1.19
TSNARE1-201ENST00000307180 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFYVE9O95405 1425 aa22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-201ENST00000307180 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-201ENST00000307180 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-201ENST00000307180 BCANQ96GW7 911 aa22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-201ENST00000307180 MED14O60244 1454 aa22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-201ENST00000307180 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-201ENST00000307180 IQGAP1P46940 1657 aa22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-201ENST00000307180 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-201ENST00000307180 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-201ENST00000307180 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-201ENST00000307180 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-201ENST00000307180 PPLO60437 1756 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-201ENST00000307180 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-201ENST00000307180 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-201ENST00000307180 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-201ENST00000307180 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-201ENST00000307180 IFT172Q9UG01 1749 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-201ENST00000307180 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-201ENST00000307180 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-201ENST00000307180 TBX22Q9Y458 520 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-201ENST00000307180 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-201ENST00000307180 MYOM2P54296 1465 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-201ENST00000307180 METP08581 1390 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-201ENST00000307180 ALKQ9UM73 1620 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-201ENST00000307180 PIK3C2GO75747 1445 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-201ENST00000307180 DIP2AQ14689 1571 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-201ENST00000307180 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-201ENST00000307180 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-201ENST00000307180 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNA6P17658 529 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 STAC3Q96MF2 364 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 PTPRUQ92729 1446 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 PIK3R4Q99570 1358 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 STK26Q9P289 416 aa22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-201ENST00000307180 CERKQ8TCT0 537 aa22.08■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 CPS1P31327 1500 aa22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 NWD1Q149M9 1564 aa22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 26.9
TSNARE1-201ENST00000307180 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 ANP32CO43423 234 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 LAMC1P11047 1609 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM94Q12767 1356 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 CCER2I3L3R5 266 aa22■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 ADGRB1O14514 1584 aa21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 C14orf37Q86TY3 774 aa21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCC11Q96J66 1382 aa21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PTCH1Q13635 1447 aa21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1-201ENST00000307180 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.6 ms