RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.36■■■□□ 2.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
PACSIN3-201ENST00000298838 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.34■■■□□ 2.29
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.33■■■□□ 2.29
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.32■■■□□ 2.28
PACSIN3-201ENST00000298838 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.31■■■□□ 2.28
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
PACSIN3-201ENST00000298838 LAMC1P11047 1609 aa29.3■■■□□ 2.28
PACSIN3-201ENST00000298838 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.3■■■□□ 2.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.29■■■□□ 2.28
PACSIN3-201ENST00000298838 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.29■■■□□ 2.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFYVE9O95405 1425 aa29.29■■■□□ 2.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PIK3C2GO75747 1445 aa29.28■■■□□ 2.28
PACSIN3-201ENST00000298838 USP47Q96K76 1375 aa29.26■■■□□ 2.27
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.24■■■□□ 2.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPRMP28827 1452 aa29.23■■■□□ 2.27
PACSIN3-201ENST00000298838 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.23■■■□□ 2.27
PACSIN3-201ENST00000298838 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PACSIN3-201ENST00000298838 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.18■■■□□ 2.26
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.18■■■□□ 2.26
PACSIN3-201ENST00000298838 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.18■■■□□ 2.26
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.26
PACSIN3-201ENST00000298838 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
PACSIN3-201ENST00000298838 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
PACSIN3-201ENST00000298838 IQGAP1P46940 1657 aa29.15■■■□□ 2.26
PACSIN3-201ENST00000298838 SLIT1O75093 1534 aa29.12■■■□□ 2.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PACSIN3-201ENST00000298838 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRB1O14514 1584 aa29.1■■■□□ 2.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.09■■■□□ 2.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.06■■■□□ 2.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ALKQ9UM73 1620 aa29.06■■■□□ 2.24
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PACSIN3-201ENST00000298838 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.04■■■□□ 2.24
PACSIN3-201ENST00000298838 EID1Q9Y6B2 187 aa29.04■■■□□ 2.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.01■■■□□ 2.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PACSIN3-201ENST00000298838 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.01■■■□□ 2.23
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29■■■□□ 2.23
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.99■■■□□ 2.23
PACSIN3-201ENST00000298838 LTKP29376 864 aa28.99■■■□□ 2.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.99■■■□□ 2.23
PACSIN3-201ENST00000298838 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC7Q96M83 1385 aa28.94■■■□□ 2.22
PACSIN3-201ENST00000298838 BCANQ96GW7 911 aa28.94■■■□□ 2.22
PACSIN3-201ENST00000298838 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TESK2Q96S53 571 aa28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-201ENST00000298838 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.91■■■□□ 2.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.9■■■□□ 2.22
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.87■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 DIP2AQ14689 1571 aa28.87■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.87■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 MED14O60244 1454 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 TMF1P82094 1093 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 STK26Q9P289 416 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 METP08581 1390 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.85■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC24A1O60721 1099 aa28.84■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.83■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 DLC1Q96QB1 1528 aa28.83■■■□□ 2.21
PACSIN3-201ENST00000298838 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.82■■■□□ 2.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC11Q96J66 1382 aa28.8■■■□□ 2.2
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.79■■■□□ 2.2
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.79■■■□□ 2.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TBX22Q9Y458 520 aa28.79■■■□□ 2.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TECPR2O15040 1411 aa28.77■■■□□ 2.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CDCA8Q53HL2 280 aa28.76■■■□□ 2.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CPS1P31327 1500 aa28.76■■■□□ 2.19
PACSIN3-201ENST00000298838 PRAM1Q96QH2 718 aa28.74■■■□□ 2.19
PACSIN3-201ENST00000298838 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
PACSIN3-201ENST00000298838 POGKQ9P215 609 aa28.73■■■□□ 2.19
PACSIN3-201ENST00000298838 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.72■■■□□ 2.19
PACSIN3-201ENST00000298838 PIK3R4Q99570 1358 aa28.7■■■□□ 2.19
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.7■■■□□ 2.19
PACSIN3-201ENST00000298838 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
PACSIN3-201ENST00000298838 SIRT1Q96EB6 747 aa28.69■■■□□ 2.18
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPRUQ92729 1446 aa28.69■■■□□ 2.18
PACSIN3-201ENST00000298838 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.67■■■□□ 2.18
PACSIN3-201ENST00000298838 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.66■■■□□ 2.18
PACSIN3-201ENST00000298838 EVC2Q86UK5 1308 aa28.65■■■□□ 2.18
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.64■■■□□ 2.18
PACSIN3-201ENST00000298838 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.64■■■□□ 2.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PTCH1Q13635 1447 aa28.64■■■□□ 2.17
PACSIN3-201ENST00000298838 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms