RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa11.35□□□□□ -0.59
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CUX1-201ENST00000292535 PRDM2Q13029 1718 aa11.21□□□□□ -0.61
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CUX1-201ENST00000292535 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.21□□□□□ -0.61
CUX1-201ENST00000292535 KLHL34Q8N239 644 aa11.21□□□□□ -0.61
CUX1-201ENST00000292535 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
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