RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 ZFYVE9O95405 1425 aa28.31■■■□□ 2.12
MALSU1-201ENST00000287543 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.3■■■□□ 2.12
MALSU1-201ENST00000287543 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.3■■■□□ 2.12
MALSU1-201ENST00000287543 KCNA6P17658 529 aa28.29■■■□□ 2.12
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.28■■■□□ 2.12
MALSU1-201ENST00000287543 TBX22Q9Y458 520 aa28.25■■■□□ 2.11
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MALSU1-201ENST00000287543 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
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MALSU1-201ENST00000287543 PIK3R4Q99570 1358 aa28.14■■■□□ 2.1
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MALSU1-201ENST00000287543 FOXD1Q16676 465 aa28.05■■■□□ 2.08
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MALSU1-201ENST00000287543 NWD1Q149M9 1564 aa28.04■■■□□ 2.08
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MALSU1-201ENST00000287543 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.94■■■□□ 2.06
MALSU1-201ENST00000287543 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.93■■■□□ 2.06
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MALSU1-201ENST00000287543 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.51■■■□□ 2
MALSU1-201ENST00000287543 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
MALSU1-201ENST00000287543 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.5■■□□□ 1.99
MALSU1-201ENST00000287543 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.5■■□□□ 1.99
MALSU1-201ENST00000287543 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
MALSU1-201ENST00000287543 PHLPP1O60346 1717 aa27.47■■□□□ 1.99
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MALSU1-201ENST00000287543 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.44■■□□□ 1.98
MALSU1-201ENST00000287543 ORAI2Q96SN7 254 aa27.44■■□□□ 1.98
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