RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282096.8

PDE3B-201, Transcript of phosphodiesterase 3B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE3B, Length 6,076 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3B-201ENST00000282096 CRBNQ96SW2 442 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 TPM2P07951 284 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 WWC1Q8IX03 1113 aa21.61■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.6■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 MSH5O43196 834 aa21.58■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 UACAQ9BZF9 1416 aa21.58■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.58■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 IFT57Q9NWB7 429 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 FBXW7Q969H0 707 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.042e-6■■■□□ 14.9
PDE3B-201ENST00000282096 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.56■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 APPP05067 770 aa21.56■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.56■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.045e-6■□□□□ 8.5
PDE3B-201ENST00000282096 ATF3P18847 181 aa21.55■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.54■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 MNS1Q8NEH6 495 aa21.54■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 RUFY1Q96T51 708 aa21.54■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 AK7Q96M32 723 aa21.53■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 BICD2Q8TD16 824 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE3B-201ENST00000282096 E9PSI1 815 aa21.51■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.51■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 COG6Q9Y2V7 657 aa21.51■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 NFKBIBQ15653 356 aa21.51■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 NCAPD3P42695 1498 aa21.5■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 MAP7D2Q96T17 732 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 PSME1Q06323 249 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.47■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.47■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.47■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.47■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE3B-201ENST00000282096 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.45■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.45■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 H0YHG0 523 aa21.45■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.45■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 COG3Q96JB2 828 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 TRIM29Q14134 588 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 GRIN2BQ13224 1484 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 MRE11P49959 708 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 REC8O95072 547 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 CDR1P51861 262 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 FOSBP53539 338 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC66A2RUB6 948 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 USP47Q96K76 1375 aa21.42■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 RDXP35241 583 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 PANK3Q9H999 370 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 PRDM2Q13029 1718 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 EVC2Q86UK5 1308 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 IL27Q8NEV9 243 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 RNF214Q8ND24 703 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 NUCB2P80303 420 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PDE3B-201ENST00000282096 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.39■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.39■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.38■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.38■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.38■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 NGEFQ8N5V2 710 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 PDILTQ8N807 584 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE3B-201ENST00000282096 CPLX1O14810 134 aa21.36■■□□□ 1.01
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