RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 PLIN1O60240 522 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 POGKQ9P215 609 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 EVC2Q86UK5 1308 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 GGT6Q6P531 493 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 NEUROD2Q15784 382 aa11.33□□□□□ -0.59
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HERC3-201ENST00000264345 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 A2MP01023 1474 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 AFAP1Q8N556 730 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 BACH2Q9BYV9 841 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 APAF1O14727 1248 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 RUNDC1Q96C34 613 aa11.32□□□□□ -0.6
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HERC3-201ENST00000264345 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
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HERC3-201ENST00000264345 PLXNC1O60486 1568 aa11.3□□□□□ -0.6
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HERC3-201ENST00000264345 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 TESK2Q96S53 571 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 PDE3AQ14432 1141 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 UNC13BO14795 1591 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 SLFN5Q08AF3 891 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 CFAP44Q96MT7 982 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 PIK3C2GO75747 1445 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 ADGRL1O94910 1474 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.28□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 ATP10AO60312 1499 aa11.27□□□□□ -0.6
HERC3-201ENST00000264345 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 LAMC1P11047 1609 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 FANCAO15360 1455 aa11.27□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 WDR63Q8IWG1 891 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.25□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 NSD2O96028 1365 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 SMC4Q9NTJ3 1288 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 TRPM2O94759 1503 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 OSCARQ8IYS5 282 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 SYNMO15061 1565 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 HSCBQ8IWL3 235 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 STK26Q9P289 416 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-201ENST00000264345 PTMSP20962 102 aa11.21□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 ABCC1P33527 1531 aa11.21□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.21□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.21□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 COG6Q9Y2V7 657 aa11.21□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 ATP7AQ04656 1500 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 CASC1Q6TDU7 716 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 ITPRIPQ8IWB1 547 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 DDX19BQ9UMR2 479 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 SHROOM2Q13796 1616 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 CHD1O14646 1710 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 GSE1Q14687 1217 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 PLA2R1Q13018 1463 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
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