RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 FAM184AQ8NB25 1140 aa12.44□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 RRP9O43818 475 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 PANK1Q8TE04 598 aa12.43□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 HOMER1Q86YM7 354 aa12.43□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 RBM10P98175 930 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.421e-6■■■□□ 17.4
TTL-201ENST00000233336 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 PES1O00541 588 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 GGT6Q6P531 493 aa12.42□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.42□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 28.8
TTL-201ENST00000233336 TPM1P09493 284 aa12.42□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa12.42□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 CCDC70Q6NSX1 233 aa12.41□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 LNPKQ9C0E8 428 aa12.41□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.4□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 PDE4CQ08493 712 aa12.4□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.4□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 NGEFQ8N5V2 710 aa12.4□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 CCDC173Q0VFZ6 552 aa12.4□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 BACH2Q9BYV9 841 aa12.4□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 RNF214Q8ND24 703 aa12.39□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 BICD2Q8TD16 824 aa12.39□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 ROCK1Q13464 1354 aa12.39□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 AAMPQ13685 434 aa12.39□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.39□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa12.38□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 MSH5O43196 834 aa12.38□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 SASS6Q6UVJ0 657 aa12.38□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 ANO2Q9NQ90 1003 aa12.38□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 TRAK1Q9UPV9 953 aa12.38□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 RUFY2Q8WXA3 655 aa12.37□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 FBXW7Q969H0 707 aa12.37□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.37□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 MLECQ14165 292 aa12.36□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 RUNDC1Q96C34 613 aa12.36□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 CHMP4CQ96CF2 233 aa12.36□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.35□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 MNS1Q8NEH6 495 aa12.35□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.35□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 TSPY26PQ9H489 355 aa12.35□□□□□ -0.43
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TTL-201ENST00000233336 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.34□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 GRPEL1Q9HAV7 217 aa12.34□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 CDC45O75419 566 aa12.34□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 KIF3BO15066 747 aa12.34□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 MBD3O95983 291 aa12.33□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 RDXP35241 583 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.43
TTL-201ENST00000233336 EVC2Q86UK5 1308 aa12.33□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.33□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 TOMM22Q9NS69 142 aa12.33□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 MIA2Q96PC5 1412 aa12.33□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 RIPK4P57078 832 aa12.33□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 UQCRHLA0A096LP55 91 aa12.32□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 UQCRHP07919 91 aa12.32□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 AMPHP49418 695 aa12.32□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.32□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 HSP90B2PQ58FF3 399 aa12.31□□□□□ -0.44
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TTL-201ENST00000233336 H0YHG0 523 aa12.31□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 ESPNB1AK53 854 aa12.31□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
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TTL-201ENST00000233336 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa12.3□□□□□ -0.44
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TTL-201ENST00000233336 CEP89Q96ST8 783 aa12.3□□□□□ -0.44
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TTL-201ENST00000233336 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa12.3□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 AK7Q96M32 723 aa12.3□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12.3□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 ACBD3Q9H3P7 528 aa12.3□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.3□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 RNF20Q5VTR2 975 aa12.3□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 RUFY1Q96T51 708 aa12.29□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
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