RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
INO80B-201ENST00000233331 HDGFP51858 240 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
INO80B-201ENST00000233331 CLTCL1P53675 1640 aa45.8■■■■■ 4.92
INO80B-201ENST00000233331 BCANQ96GW7 911 aa45.77■■■■■ 4.92
INO80B-201ENST00000233331 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP45.75■■■■■ 4.91
INO80B-201ENST00000233331 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa45.74■■■■■ 4.91
INO80B-201ENST00000233331 SLC26A8Q96RN1 970 aa45.74■■■■■ 4.91
INO80B-201ENST00000233331 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
INO80B-201ENST00000233331 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP45.71■■■■■ 4.91
INO80B-201ENST00000233331 UBAP1LF5GYI3 381 aa45.67■■■■■ 4.9
INO80B-201ENST00000233331 LRRC7Q96NW7 1537 aa45.67■■■■■ 4.9
INO80B-201ENST00000233331 FOXD1Q16676 465 aa45.65■■■■■ 4.9
INO80B-201ENST00000233331 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
INO80B-201ENST00000233331 MPHOSPH9Q99550 1183 aa45.65■■■■■ 4.9
INO80B-201ENST00000233331 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
INO80B-201ENST00000233331 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa45.65■■■■■ 4.9
INO80B-201ENST00000233331 KIF1BO60333 1816 aa45.65■■■■■ 4.9
INO80B-201ENST00000233331 KCNA6P17658 529 aa45.56■■■■■ 4.88
INO80B-201ENST00000233331 NWD1Q149M9 1564 aa45.54■■■■■ 4.88
INO80B-201ENST00000233331 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa45.52■■■■■ 4.88
INO80B-201ENST00000233331 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa45.52■■■■■ 4.88
INO80B-201ENST00000233331 DIP2AQ14689 1571 aa45.52■■■■■ 4.88
INO80B-201ENST00000233331 TBX22Q9Y458 520 aa45.5■■■■■ 4.87
INO80B-201ENST00000233331 TOM1O60784 492 aa45.48■■■■■ 4.87
INO80B-201ENST00000233331 CCDC144AA2RUR9 1427 aa45.48■■■■■ 4.87
INO80B-201ENST00000233331 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
INO80B-201ENST00000233331 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
INO80B-201ENST00000233331 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
INO80B-201ENST00000233331 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa45.42■■■■■ 4.86
INO80B-201ENST00000233331 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa45.42■■■■■ 4.86
INO80B-201ENST00000233331 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
INO80B-201ENST00000233331 TMEM94Q12767 1356 aa45.41■■■■■ 4.86
INO80B-201ENST00000233331 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP45.4■■■■■ 4.86
INO80B-201ENST00000233331 PIP4K2BP78356 416 aa45.39■■■■■ 4.86
INO80B-201ENST00000233331 ALKQ9UM73 1620 aa45.37■■■■■ 4.85
INO80B-201ENST00000233331 PIK3R4Q99570 1358 aa45.36■■■■■ 4.85
INO80B-201ENST00000233331 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa45.33■■■■■ 4.85
INO80B-201ENST00000233331 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP45.33■■■■■ 4.85
INO80B-201ENST00000233331 HRCP23327 699 aa45.31■■■■■ 4.84
INO80B-201ENST00000233331 PPLO60437 1756 aa45.3■■■■■ 4.84
INO80B-201ENST00000233331 VGFO15240 615 aaPredicted RBP45.28■■■■■ 4.84
INO80B-201ENST00000233331 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa45.27■■■■■ 4.84
INO80B-201ENST00000233331 PTPRUQ92729 1446 aa45.25■■■■■ 4.83
INO80B-201ENST00000233331 RGL3Q3MIN7 710 aa45.23■■■■■ 4.83
INO80B-201ENST00000233331 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa45.21■■■■■ 4.83
INO80B-201ENST00000233331 METP08581 1390 aa45.2■■■■■ 4.83
INO80B-201ENST00000233331 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
INO80B-201ENST00000233331 MSH6P52701 1360 aa45.17■■■■■ 4.82
INO80B-201ENST00000233331 IFT172Q9UG01 1749 aa45.15■■■■■ 4.82
INO80B-201ENST00000233331 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa45.12■■■■■ 4.81
INO80B-201ENST00000233331 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
INO80B-201ENST00000233331 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa45.11■■■■■ 4.81
INO80B-201ENST00000233331 HSPA1LP34931 641 aa45.11■■■■■ 4.81
INO80B-201ENST00000233331 C14orf37Q86TY3 774 aa45.1■■■■■ 4.81
INO80B-201ENST00000233331 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa45.08■■■■■ 4.81
INO80B-201ENST00000233331 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP44.97■■■■■ 4.79
INO80B-201ENST00000233331 FAM135BQ49AJ0 1406 aa44.96■■■■■ 4.79
INO80B-201ENST00000233331 PIK3C2GO75747 1445 aa44.94■■■■■ 4.79
INO80B-201ENST00000233331 C19orf44Q9H6X5 657 aa44.94■■■■■ 4.78
INO80B-201ENST00000233331 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa44.93■■■■■ 4.78
INO80B-201ENST00000233331 MYOM2P54296 1465 aa44.91■■■■■ 4.78
INO80B-201ENST00000233331 PTCH1Q13635 1447 aa44.91■■■■■ 4.78
INO80B-201ENST00000233331 SLAIN2Q9P270 581 aa44.9■■■■■ 4.78
INO80B-201ENST00000233331 ATF3P18847 181 aa44.89■■■■■ 4.78
INO80B-201ENST00000233331 CADPS2Q86UW7 1296 aa44.88■■■■■ 4.78
INO80B-201ENST00000233331 PRAG1Q86YV5 1406 aa44.86■■■■■ 4.77
INO80B-201ENST00000233331 NRXN1Q9ULB1 1477 aa44.85■■■■■ 4.77
INO80B-201ENST00000233331 ROBO2Q9HCK4 1378 aa44.84■■■■■ 4.77
INO80B-201ENST00000233331 DCCP43146 1447 aa44.84■■■■■ 4.77
INO80B-201ENST00000233331 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa44.84■■■■■ 4.77
INO80B-201ENST00000233331 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa44.82■■■■■ 4.77
INO80B-201ENST00000233331 NALCNQ8IZF0 1738 aa44.81■■■■■ 4.76
INO80B-201ENST00000233331 LAMC1P11047 1609 aa44.76■■■■■ 4.76
INO80B-201ENST00000233331 DISP3Q9P2K9 1392 aa44.75■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 TMEM132EQ6IEE7 984 aa44.75■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 STK26Q9P289 416 aa44.74■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 DCAF11Q8TEB1 546 aa44.72■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 CFAP70Q5T0N1 1121 aa44.71■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa44.71■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 TECPR2O15040 1411 aa44.7■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 KNDC1Q76NI1 1749 aa44.7■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 MST1RQ04912 1400 aa44.68■■■■■ 4.74
INO80B-201ENST00000233331 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
INO80B-201ENST00000233331 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
INO80B-201ENST00000233331 PHLPP1O60346 1717 aa44.66■■■■■ 4.74
INO80B-201ENST00000233331 ABCC11Q96J66 1382 aa44.66■■■■■ 4.74
INO80B-201ENST00000233331 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP44.64■■■■■ 4.74
INO80B-201ENST00000233331 STAC3Q96MF2 364 aa44.61■■■■■ 4.73
INO80B-201ENST00000233331 BRINP3Q76B58 766 aa44.59■■■■■ 4.73
INO80B-201ENST00000233331 WAPLQ7Z5K2 1190 aa44.58■■■■■ 4.73
INO80B-201ENST00000233331 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
INO80B-201ENST00000233331 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa44.55■■■■■ 4.72
INO80B-201ENST00000233331 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
INO80B-201ENST00000233331 ADGRB1O14514 1584 aa44.52■■■■■ 4.72
INO80B-201ENST00000233331 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa44.52■■■■■ 4.72
INO80B-201ENST00000233331 C1orf167Q5SNV9 1468 aa44.52■■■■■ 4.72
INO80B-201ENST00000233331 SIRT1Q96EB6 747 aa44.46■■■■■ 4.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms