RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229195.7

CNOT2-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT2, Length 3,282 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-201ENST00000229195 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.88□□□□□ -0.03
CNOT2-201ENST00000229195 SYNMO15061 1565 aa14.87□□□□□ -0.03
CNOT2-201ENST00000229195 NEFLP07196 543 aa14.87□□□□□ -0.03
CNOT2-201ENST00000229195 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.87□□□□□ -0.03
CNOT2-201ENST00000229195 MADDQ8WXG6 1647 aa14.86□□□□□ -0.03
CNOT2-201ENST00000229195 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.86□□□□□ -0.03
CNOT2-201ENST00000229195 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CNOT2-201ENST00000229195 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.85□□□□□ -0.03
CNOT2-201ENST00000229195 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CNOT2-201ENST00000229195 MSH5O43196 834 aa14.83□□□□□ -0.03
CNOT2-201ENST00000229195 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.83□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 ADGRB3O60242 1522 aa14.83□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.82□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 TESK2Q96S53 571 aa14.82□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 AGLP35573 1532 aa14.82□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.81□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.81□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.81□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.8□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 ZMYM3Q14202 1370 aa14.8□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 ERVK-7P63135 1459 aa14.8□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 REREQ9P2R6 1566 aa14.8□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.8□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 CCDC184Q52MB2 194 aa14.79□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 STK26Q9P289 416 aa14.77□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.04
CNOT2-201ENST00000229195 PIK3C2BO00750 1634 aa14.77□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 IFT172Q9UG01 1749 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 MYOM2P54296 1465 aa14.76□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 PPLO60437 1756 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.75□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 TMF1P82094 1093 aa14.74□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 STAC3Q96MF2 364 aa14.74□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 PIK3C2GO75747 1445 aa14.73□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.73□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.72□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.72□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.72□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.72□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.71□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.71□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.71□□□□□ -0.05
CNOT2-201ENST00000229195 IQGAP1P46940 1657 aa14.71□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 LAMC1P11047 1609 aa14.7□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 PANK3Q9H999 370 aa14.7□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 CCER2I3L3R5 266 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 TNRQ92752 1358 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 MRS2Q9HD23 443 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.66□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 ADGRB1O14514 1584 aa14.65□□□□□ -0.06
CNOT2-201ENST00000229195 TMC1Q8TDI8 760 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 PRAM1Q96QH2 718 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 LTKP29376 864 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 POGKQ9P215 609 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 CABP2Q9NPB3 220 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 C3P01024 1663 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 ZFYVE9O95405 1425 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 CDCA8Q53HL2 280 aa14.58□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 ALKQ9UM73 1620 aa14.58□□□□□ -0.07
CNOT2-201ENST00000229195 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 PTPRMP28827 1452 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 METP08581 1390 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT2-201ENST00000229195 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms