RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 TNRQ92752 1358 aa27.13■■□□□ 1.93
IFRD1-201ENST00000005558 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.13■■□□□ 1.93
IFRD1-201ENST00000005558 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.13■■□□□ 1.93
IFRD1-201ENST00000005558 LAMC1P11047 1609 aa27.1■■□□□ 1.93
IFRD1-201ENST00000005558 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
IFRD1-201ENST00000005558 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.1■■□□□ 1.93
IFRD1-201ENST00000005558 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
IFRD1-201ENST00000005558 PIK3C2GO75747 1445 aa27.07■■□□□ 1.92
IFRD1-201ENST00000005558 USP47Q96K76 1375 aa27.07■■□□□ 1.92
IFRD1-201ENST00000005558 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.06■■□□□ 1.92
IFRD1-201ENST00000005558 ZFYVE9O95405 1425 aa27.06■■□□□ 1.92
IFRD1-201ENST00000005558 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.06■■□□□ 1.92
IFRD1-201ENST00000005558 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
IFRD1-201ENST00000005558 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
IFRD1-201ENST00000005558 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.03■■□□□ 1.92
IFRD1-201ENST00000005558 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
IFRD1-201ENST00000005558 IQGAP1P46940 1657 aa27.01■■□□□ 1.91
IFRD1-201ENST00000005558 NLRP1Q9C000 1473 aa27.01■■□□□ 1.91
IFRD1-201ENST00000005558 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
IFRD1-201ENST00000005558 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
IFRD1-201ENST00000005558 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
IFRD1-201ENST00000005558 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.97■■□□□ 1.91
IFRD1-201ENST00000005558 ADGRB1O14514 1584 aa26.97■■□□□ 1.91
IFRD1-201ENST00000005558 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.96■■□□□ 1.91
IFRD1-201ENST00000005558 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.96■■□□□ 1.91
IFRD1-201ENST00000005558 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.95■■□□□ 1.9
IFRD1-201ENST00000005558 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.95■■□□□ 1.9
IFRD1-201ENST00000005558 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.94■■□□□ 1.9
IFRD1-201ENST00000005558 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.94■■□□□ 1.9
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IFRD1-201ENST00000005558 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.9■■□□□ 1.9
IFRD1-201ENST00000005558 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.9■■□□□ 1.9
IFRD1-201ENST00000005558 PTPRMP28827 1452 aa26.9■■□□□ 1.9
IFRD1-201ENST00000005558 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
IFRD1-201ENST00000005558 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 TESK2Q96S53 571 aa26.88■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.87■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 CCDC7Q96M83 1385 aa26.87■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 ALKQ9UM73 1620 aa26.87■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.86■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 SLIT1O75093 1534 aa26.85■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.84■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 LTKP29376 864 aa26.83■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
IFRD1-201ENST00000005558 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
IFRD1-201ENST00000005558 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.77■■□□□ 1.88
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IFRD1-201ENST00000005558 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.76■■□□□ 1.87
IFRD1-201ENST00000005558 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
IFRD1-201ENST00000005558 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.74■■□□□ 1.87
IFRD1-201ENST00000005558 MED14O60244 1454 aa26.72■■□□□ 1.87
IFRD1-201ENST00000005558 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.72■■□□□ 1.87
IFRD1-201ENST00000005558 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.72■■□□□ 1.87
IFRD1-201ENST00000005558 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.72■■□□□ 1.87
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IFRD1-201ENST00000005558 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
IFRD1-201ENST00000005558 MIER1Q8N108 512 aa26.69■■□□□ 1.86
IFRD1-201ENST00000005558 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
IFRD1-201ENST00000005558 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.67■■□□□ 1.86
IFRD1-201ENST00000005558 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.65■■□□□ 1.86
IFRD1-201ENST00000005558 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
IFRD1-201ENST00000005558 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
IFRD1-201ENST00000005558 STK26Q9P289 416 aa26.63■■□□□ 1.85
IFRD1-201ENST00000005558 EID1Q9Y6B2 187 aa26.62■■□□□ 1.85
IFRD1-201ENST00000005558 TMF1P82094 1093 aa26.61■■□□□ 1.85
IFRD1-201ENST00000005558 DLC1Q96QB1 1528 aa26.61■■□□□ 1.85
IFRD1-201ENST00000005558 ABCC11Q96J66 1382 aa26.6■■□□□ 1.85
IFRD1-201ENST00000005558 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.59■■□□□ 1.85
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IFRD1-201ENST00000005558 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.58■■□□□ 1.84
IFRD1-201ENST00000005558 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.57■■□□□ 1.84
IFRD1-201ENST00000005558 TECPR2O15040 1411 aa26.57■■□□□ 1.84
IFRD1-201ENST00000005558 MYOM1P52179 1685 aa26.56■■□□□ 1.84
IFRD1-201ENST00000005558 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.55■■□□□ 1.84
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IFRD1-201ENST00000005558 TBX22Q9Y458 520 aa26.55■■□□□ 1.84
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IFRD1-201ENST00000005558 DIP2AQ14689 1571 aa26.54■■□□□ 1.84
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IFRD1-201ENST00000005558 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.53■■□□□ 1.84
IFRD1-201ENST00000005558 BCANQ96GW7 911 aa26.53■■□□□ 1.84
IFRD1-201ENST00000005558 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.51■■□□□ 1.83
IFRD1-201ENST00000005558 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
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IFRD1-201ENST00000005558 SIRT1Q96EB6 747 aa26.49■■□□□ 1.83
IFRD1-201ENST00000005558 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.47■■□□□ 1.83
IFRD1-201ENST00000005558 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
IFRD1-201ENST00000005558 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
IFRD1-201ENST00000005558 SLC24A1O60721 1099 aa26.46■■□□□ 1.83
IFRD1-201ENST00000005558 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.45■■□□□ 1.83
IFRD1-201ENST00000005558 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.44■■□□□ 1.82
IFRD1-201ENST00000005558 CDCA8Q53HL2 280 aa26.44■■□□□ 1.82
IFRD1-201ENST00000005558 POGKQ9P215 609 aa26.44■■□□□ 1.82
IFRD1-201ENST00000005558 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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