RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088356.9

Usf3-201, Transcript of Gene model 608, (NCBI), mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Usf3, Length 757 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3-201ENSMUST00000088356 Evi5lH3BKQ3 813 aa26.91■■□□□ 1.9
Usf3-201ENSMUST00000088356 Arap3Q8R5G7 1538 aa26.9■■□□□ 1.9
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ttll13A4Q9F6 804 aa26.89■■□□□ 1.9
Usf3-201ENSMUST00000088356 PplQ9R269 1755 aa26.89■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa26.88■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 Efcab6Q6P1E8 1516 aa26.88■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa26.87■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sema6bO54951 886 aa26.86■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 Adgrl1Q80TR1 1466 aa26.86■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tns3Q5SSZ5 1440 aa26.85■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 PalldQ9ET54 1408 aa26.85■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 NinlQ6ZQ12 1394 aa26.84■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 Qtrt2B8ZXI1 415 aa26.83■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 Slain2Q8CI08 581 aa26.83■■□□□ 1.89
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cntnap1O54991 1385 aa26.83■■□□□ 1.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Asxl2Q8BZ32 1370 aa26.81■■□□□ 1.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 PtprvP70289 1705 aa26.8■■□□□ 1.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Atp7aQ64430 1491 aa26.77■■□□□ 1.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Myom3A2ABU4 1439 aa26.77■■□□□ 1.88
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Zranb1Q7M760 708 aa26.77■■□□□ 1.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Erich6D3Z6S9 713 aa26.76■■□□□ 1.87
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Iqgap3F8VQ29 1632 aa26.75■■□□□ 1.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Uggt1Q6P5E4 1551 aa26.75■■□□□ 1.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tecpr2Q3UH45 1423 aa26.74■■□□□ 1.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Slit3Q9WVB4 1523 aa26.74■■□□□ 1.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ildr2B5TVM2 661 aa26.72■■□□□ 1.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Arhgef28P97433 1693 aa26.71■■□□□ 1.87
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Lrp6O88572 1613 aa26.68■■□□□ 1.86
Usf3-201ENSMUST00000088356 Dmrt2Q8BG36 561 aa26.68■■□□□ 1.86
Usf3-201ENSMUST00000088356 Stk24Q99KH8 431 aa26.68■■□□□ 1.86
Usf3-201ENSMUST00000088356 Clstn2Q9ER65 966 aa26.68■■□□□ 1.86
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tarbp1E9Q368 1579 aa26.67■■□□□ 1.86
Usf3-201ENSMUST00000088356 Siglec1Q62230 1695 aa26.67■■□□□ 1.86
Usf3-201ENSMUST00000088356 MypopQ8R4U1 393 aa26.67■■□□□ 1.86
Usf3-201ENSMUST00000088356 Zfp142G5E869 1843 aa26.67■■□□□ 1.86
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mroh1E0CZ22 1640 aa26.64■■□□□ 1.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa26.63■■□□□ 1.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 UacaQ8CGB3 1411 aa26.63■■□□□ 1.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cd109Q8R422 1442 aa26.62■■□□□ 1.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nwd1A6H603 1563 aa26.6■■□□□ 1.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Atf3Q60765 181 aa26.6■■□□□ 1.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rfx7F8VPJ6 1459 aa26.6■■□□□ 1.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Znf526Q8BI66 675 aa26.59■■□□□ 1.85
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tmem94Q7TSH8 1360 aa26.58■■□□□ 1.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ggt6Q6PDE7 497 aa26.57■■□□□ 1.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Col14a1Q80X19 1797 aa26.55■■□□□ 1.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa26.54■■□□□ 1.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Dapk1Q80YE7 1442 aa26.54■■□□□ 1.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sall3Q62255 1320 aa26.53■■□□□ 1.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ttll5Q8CHB8 1328 aa26.52■■□□□ 1.84
Usf3-201ENSMUST00000088356 Abca8aQ8K442 1620 aa26.51■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 KdrP35918 1367 aa26.49■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 NalcnQ8BXR5 1738 aa26.49■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 MpndQ3TV65 487 aa26.49■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 Atp1b4Q99ME6 356 aa26.49■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 C3P01027 1663 aa26.48■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 ErbinQ80TH2 1402 aa26.47■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pik3c2gO70167 1506 aa26.46■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rgs17Q9QZB0 210 aa26.46■■□□□ 1.83
Usf3-201ENSMUST00000088356 Kif24Q6NWW5 1356 aa26.44■■□□□ 1.82
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pik3r4Q8VD65 1358 aa26.44■■□□□ 1.82
Usf3-201ENSMUST00000088356 PtprgQ05909 1442 aa26.43■■□□□ 1.82
Usf3-201ENSMUST00000088356 Q9D9H8 365 aa26.43■■□□□ 1.82
Usf3-201ENSMUST00000088356 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
Usf3-201ENSMUST00000088356 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
Usf3-201ENSMUST00000088356 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Usf3-201ENSMUST00000088356 Abcc10Q8R4P9 1501 aa26.4■■□□□ 1.82
Usf3-201ENSMUST00000088356 AatkQ80YE4 1365 aa26.4■■□□□ 1.82
Usf3-201ENSMUST00000088356 Trak1Q6PD31 939 aa26.39■■□□□ 1.82
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ift172Q6VH22 1749 aa26.38■■□□□ 1.81
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
Usf3-201ENSMUST00000088356 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
Usf3-201ENSMUST00000088356 AU022751B1B0V2 589 aa26.34■■□□□ 1.81
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa26.33■■□□□ 1.81
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ube2uB1AUC4 352 aa26.32■■□□□ 1.8
Usf3-201ENSMUST00000088356 Shq1Q7TMX5 569 aa26.32■■□□□ 1.8
Usf3-201ENSMUST00000088356 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa26.31■■□□□ 1.8
Usf3-201ENSMUST00000088356 Col22a1E9Q7P1 1613 aa26.26■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 DccP70211 1447 aa26.26■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 GnpatP98192 678 aa26.26■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cps1Q8C196 1500 aa26.25■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 Smim5Q8BT42 78 aa26.25■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa26.24■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 Emilin2Q8K482 1074 aa26.22■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa26.21■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 Wnk3Q80XP9 1757 aa26.21■■□□□ 1.79
Usf3-201ENSMUST00000088356 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa26.2■■□□□ 1.79
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