RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)L

tS(GCU)L, Transcript of Asparagine tRNA (tRNA-Asn), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tS(GCU)L, Length 80 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)LtS(GCU)L NVJ1P38881 321 aa6.84□□□□□ -1.31
tS(GCU)LtS(GCU)L SMB1P40018 196 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
tS(GCU)LtS(GCU)L BMT5P40493 336 aa6.84□□□□□ -1.31
tS(GCU)LtS(GCU)L LPP1Q04396 274 aa6.84□□□□□ -1.31
tS(GCU)LtS(GCU)L IFM1P25038 676 aa6.83□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L PDC2P32896 925 aa6.83□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L RPB7P34087 171 aa6.83□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YKR045CP36138 183 aa6.83□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L SYS1P41544 203 aa6.83□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L BXI1P48558 297 aa6.83□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L CTF19Q02732 369 aa6.83□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L DPB4Q04603 196 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L TAF3Q12297 353 aa6.83□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YLR099W-AQ3E798 87 aa6.83□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YLL053CP0CD98 152 aa6.82□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L PET54P10834 293 aa6.82□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L CKA1P15790 372 aa6.82□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L VMA5P31412 392 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YUH1P35127 236 aa6.82□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L BNA6P43619 295 aa6.82□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L GPI14P47088 403 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YDR286CQ05530 114 aa6.82□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L TDA6Q06466 467 aa6.82□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L RPL9AP05738 191 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L RFA1P22336 621 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L SSZ1P38788 538 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L GEP4P38812 185 aa6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L SSO2P39926 295 aa6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L DOC1P53068 250 aa6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L CRH1P53301 507 aa6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L ALG9P53868 555 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L ASM4Q05166 528 aa6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YOR292CQ08743 309 aa6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L AEP3Q12089 606 aa6.81□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YMR31P19955 123 aa6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YJR012CP47087 207 aa6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L VMA10P48836 114 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L IMD3P50095 523 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L ERP6P53198 216 aa6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L FMP48P53233 369 aa6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L SLX9P53251 210 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YGR219WP53307 113 aa6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YDR179W-AQ03983 463 aa6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L PBP4Q07362 185 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L INP53Q12271 1107 aa6.8□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L GCN4P03069 281 aa6.79□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L ECM33P38248 429 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L FCY21P40039 528 aa6.79□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YGR210CP42942 411 aa6.79□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YFR035CP43608 114 aa6.79□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L MRPL22P53881 309 aa6.79□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L BUD25P85052 153 aa6.79□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L RKI1Q12189 258 aa6.79□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YLR365WQ7LIF2 110 aa6.79□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L AAC1P04710 309 aa6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L TRP4P07285 380 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L CHO1P08456 276 aa6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L ROX3P25046 220 aa6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L AGA2P32781 87 aa6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L ALK2P32789 676 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data6.78□□□□□ -1.32not detected
tS(GCU)LtS(GCU)L SRL3P36167 246 aa6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L MDJ2P42834 146 aa6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L CAB5Q03941 241 aa6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data6.78□□□□□ -1.32not detected
tS(GCU)LtS(GCU)L YPL199CQ08954 240 aa6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L MED11Q99278 115 aa6.78□□□□□ -1.32
tS(GCU)LtS(GCU)L YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa6.77□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L URA3P03962 267 aa6.77□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L MRS3P10566 314 aa6.77□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L YBR197CP38306 217 aa6.77□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L MIC12P38341 106 aa6.77□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L PCL7P40186 285 aa6.77□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L YAE1P47118 141 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L CWC25P53854 179 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L MED8P38304 223 aa6.76□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L MSS2P40990 351 aa6.76□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L YMR130WQ04223 302 aa6.76□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L BOL1Q3E793 110 aa6.76□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L YPR108W-AQ3E7B3 70 aa6.76□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L HTB1P02293 131 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L MRS4P23500 304 aa6.75□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L ATG18P43601 500 aa6.75□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L ODC2Q99297 307 aa6.75□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L HIS3P06633 220 aa6.74□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L URA6P15700 204 aa6.74□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L UBP8P50102 471 aa6.74□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L FSH2Q05015 223 aa6.74□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L PEX10Q05568 337 aa6.74□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L VPS63O13549 108 aa6.73□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L NRG2P38082 220 aa6.73□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L YMR181CQ03231 154 aa6.73□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L TSA2Q04120 196 aa6.73□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L TRI1Q05024 226 aa6.73□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L HRD1Q08109 551 aa6.73□□□□□ -1.33
tS(GCU)LtS(GCU)L YNG1Q08465 219 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 228.3 ms