RNA–Protein interactions for RNA: YOR359W

VTS1, Transcript of Flap-structured DNA-binding and RNA-binding protein, yeast

Gene VTS1, Length 1,572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VTS1	YOR359W	TRR2	P38816	342 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	AYR1	P40471	297 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	TIM10	P87108	93 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YMR166C	Q03829	368 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	THI74	Q04083	370 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	EMI1	Q04406	187 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	INM2	Q05533	292 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	SOR2	Q07786	357 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YOS1	Q3E834	85 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YRF1-6	P53819	1859 aa		6.07	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	CYC3	P06182	269 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	INO4	P13902	151 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	CUP2	P15315	225 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YCR007C	P25354	239 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YMC2	P38087	329 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	TAT2	P38967	592 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	ERG28	P40030	148 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PHS1	P40857	217 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	TTI2	P47168	421 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	LYS5	P50113	272 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	CDC14	Q00684	551 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	LDS2	Q08218	356 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	HEM2	P05373	342 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	CWP1	P28319	239 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	NNK1	P36003	928 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	SAF1	P38352	637 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	LTP1	P40347	161 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	ATG27	P46989	271 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	BNA2	P47125	453 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	COQ5	P49017	307 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PER33	Q12144	273 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	GSC2	P40989	1895 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	GPI12	P23797	304 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PAU16	P35994	123 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	SHE1	P38200	338 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PEX7	P39108	375 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	HIT1	P46973	164 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	TSA2	Q04120	196 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	SUE1	Q06524	206 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	MCT1	Q12283	360 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	TOA2	P32774	122 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	SLC1	P33333	303 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	SKN1	P33336	771 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	TIR2	P33890	251 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PSD1	P39006	500 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PIC2	P40035	300 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YNL198C	P40166	100 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YFL054C	P43549	646 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	MTM1	P53320	366 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	IBD2	P53892	351 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	IGO1	P53897	168 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	AIM34	Q03673	198 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	DIC1	Q06143	298 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PRM3	Q08931	133 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	IZH2	Q12442	317 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	COX1	P00401	534 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	HVG1	P0CE11	249 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	UTR2	P32623	467 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	ZRT1	P32804	376 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	TIM23	P32897	222 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	GCS1	P35197	352 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	DRE2	P36152	348 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	GEX2	P36173	615 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YER076C	P40049	302 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	MAF1	P41910	395 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YMR210W	Q03649	449 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	YOR385W	Q08909	290 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	PFA4	Q12006	378 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	POM34	Q12445	299 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	RAX2	Q12465	1220 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VTS1	YOR359W	ATS1	P31386	333 aa		6.02	□□□□□ -1.45
VTS1	YOR359W	YSC83	P32792	385 aa		6.02	□□□□□ -1.45
VTS1	YOR359W	DUT1	P33317	147 aa		6.02	□□□□□ -1.45
VTS1	YOR359W	PPZ2	P33329	710 aa		6.02	□□□□□ -1.45
VTS1	YOR359W	YKL070W	P36087	169 aa		6.02	□□□□□ -1.45
VTS1	YOR359W	THI2	P38141	450 aa		6.02	□□□□□ -1.45

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