RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	JID1	Q12350	301 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	BBP1	Q12365	385 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	TRP1	P00912	224 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	SEC22	P22214	214 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	YBR062C	P38239	180 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	SEN34	P39707	275 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	YER076C	P40049	302 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	PEX17	P40155	199 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	PRM5	P40476	318 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	RPR2	P40571	144 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	COS10	P52924	374 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	GOT1	Q03554	138 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	MIM1	Q08176	113 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	TRX3	P25372	127 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	OAC1	P32332	324 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	FRM2	P37261	193 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	SHE1	P38200	338 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	NVJ1	P38881	321 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	AVT7	P40501	490 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	PRM10	P42946	383 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	NCA3	P46955	337 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	VHS1	Q03785	461 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	YPR127W	Q06494	345 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	MHT1	Q12525	324 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPS1B	YML063W	COX4	P04037	155 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	SNF4	P12904	322 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	AHC2	P25649	128 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	CSE2	P33308	149 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	OPY1	P38271	328 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YHL026C	P38740	315 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YER186C	P40101	306 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	UBC12	P52491	188 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	PRM8	P53174	237 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YGL034C	P53186	121 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YGR015C	P53208	328 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YNL184C	P53876	108 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YPL113C	Q02961	396 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	CSN9	Q03981	162 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YLR031W	Q07978	186 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	FDH1	Q08911	376 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	PEX11	Q12462	236 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	POP8	P38208	133 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YIL152W	P40455	235 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	ATG18	P43601	500 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	AIM34	Q03673	198 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	FMP42	Q04991	504 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	FMP27	Q06179	2628 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	IES4	Q08561	116 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YPL229W	Q99395	206 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	CUP2	P15315	225 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	EPT1	P22140	391 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	TCA17	P32613	152 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	BDH1	P39714	382 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YJL213W	P40896	331 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	BNS1	P50084	137 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	CRZ1	P53968	678 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	PET191	Q02772	108 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YDR476C	Q03362	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YLR046C	Q12253	270 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	TRM10	Q12400	293 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	TOR1	P35169	2470 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	CPR4	P25334	318 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	IMP1	P28627	190 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	ERG2	P32352	222 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	SOL2	P37262	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YER189W	P40104	122 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	COQ5	P49017	307 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	CRH1	P53301	507 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	DYN2	Q02647	92 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	SWP1	Q02795	286 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPS1B	YML063W	MRX11	Q03079	207 aa		3.55	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 93.5 ms