RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W VMA5P31412 392 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W ECM27P47144 725 aa7.07□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W BXI1P48558 297 aa7.07□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W DOC1P53068 250 aa7.07□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W FMP48P53233 369 aa7.07□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W DGK1Q12382 290 aa7.07□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W SPS18P32572 300 aa7.06□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W UTP30P36144 274 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W NVJ1P38881 321 aa7.06□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W CTF19Q02732 369 aa7.06□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W LPP1Q04396 274 aa7.06□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W AHC2P25649 128 aa7.05□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W RFA3P26755 122 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W IKI1P38874 309 aa7.05□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W COX15P40086 486 aa7.05□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W PCL7P40186 285 aa7.05□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W GPI14P47088 403 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W YDR274CP87283 123 aa7.05□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W RFA1P22336 621 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W LSB5P25369 354 aa7.04□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W RPB7P34087 171 aa7.04□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W YLF2P38746 405 aa7.04□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W HAM1P47119 197 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W SOL1P50278 321 aa7.04□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W TLG1Q03322 224 aa7.04□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W TSA2Q04120 196 aa7.04□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W IRC23Q08416 157 aa7.04□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W GCN4P03069 281 aa7.03□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W NRG2P38082 220 aa7.03□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W ECM33P38248 429 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W CRH1P53301 507 aa7.03□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa7.02□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W GAL1P04385 528 aa7.02□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YPS1P32329 569 aa7.02□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YJL163CP46996 555 aa7.02□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W TRM10Q12400 293 aa7.02□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W ODC2Q99297 307 aa7.02□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W COX2P00410 251 aa7.01□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W GRX2P17695 143 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W MRP20P32387 263 aa7.01□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W HYM1P32464 399 aa7.01□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W SRL3P36167 246 aa7.01□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W BUL1P48524 976 aa7.01□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W UBP8P50102 471 aa7.01□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W IMO32P53219 342 aa7.01□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W ALG9P53868 555 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W CDC31P06704 161 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data7□□□□□ -1.29not detected
YLR349WYLR349W MPC2P38857 129 aa7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YGR210CP42942 411 aa7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W DIE2P50076 525 aa7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W CAX4P53223 239 aa7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W MAK3Q03503 176 aa7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W CAB5Q03941 241 aa7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W TDA6Q06466 467 aa7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YOR292CQ08743 309 aa7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W INP53Q12271 1107 aa7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YJR112W-AQ3E743 109 aa7□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W HTB1P02293 131 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W FUS3P16892 353 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W GEP4P38812 185 aa6.99□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W PRM5P40476 318 aa6.99□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YIL060WP40519 144 aa6.99□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W TDA1Q03533 586 aa6.99□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W ASM4Q05166 528 aa6.99□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YDR286CQ05530 114 aa6.99□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data6.99□□□□□ -1.29not detected
YLR349WYLR349W TAR1Q8TGM6 124 aa6.99□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W AAC1P04710 309 aa6.98□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W ROX3P25046 220 aa6.98□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YBR137WP38276 179 aa6.98□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W BMT5P40493 336 aa6.98□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YFH1Q07540 174 aa6.98□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W RBD2Q12270 262 aa6.98□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W YER137CP40083 148 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W SYS1P41544 203 aa6.97□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W MED11Q99278 115 aa6.97□□□□□ -1.29
YLR349WYLR349W HIS3P06633 220 aa6.96□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W PUP1P25043 261 aa6.96□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W PDC2P32896 925 aa6.96□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YBR197CP38306 217 aa6.96□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W IMD2P38697 523 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W FCY21P40039 528 aa6.96□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W ATG18P43601 500 aa6.96□□□□□ -1.3
YLR349WYLR349W YJR012CP47087 207 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.4 ms