RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W AIM32Q04689 311 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YMR253CQ04835 414 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W RNH202Q05635 350 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W BER1Q06688 274 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PLB3Q08108 686 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W MMT2Q08970 484 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PER33Q12144 273 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W FRE6Q12473 712 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PCL9Q12477 304 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YDL012CQ12489 107 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W Q0144Q9ZZW2 109 aa2.3□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W COX3P00420 269 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W CBS1P14066 229 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W SPO7P18410 259 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PPH21P23594 369 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W POP5P28005 173 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W TCA17P32613 152 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YEF1P32622 495 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W NTF2P33331 125 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YCR087C-AP37263 153 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PAU24P38155 120 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PRM9P39551 298 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W SYS1P41544 203 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W ZIM17P42844 174 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PAM16P42949 149 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W NCA3P46955 337 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W STE24P47154 453 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W OST3P48439 350 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YIF1P53845 314 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W CDC14Q00684 551 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W VPS28Q02767 242 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W MET31Q03081 177 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W TSA2Q04120 196 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W SHH3Q04487 196 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W AVO2Q04749 426 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W KEI1Q06346 221 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PIN3Q06449 215 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W HEM25Q07534 307 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W ATG5Q12380 294 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YRF1-3P0CX14 1859 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YRF1-7P0CX15 1859 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YRF1-6P53819 1859 aa2.29□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W RIP1P08067 215 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PAU19P0CE85 124 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PAU21P0CE86 164 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PAU22P0CE87 164 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W SLM5P25345 492 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PAU3P25610 124 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data2.28□□□□□ -2.04not detected
YKR078WYKR078W PEX4P29340 183 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W TIP20P33891 701 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W UTH1P36135 365 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W AME1P38313 324 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W TRS20P38334 175 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W MST28P39552 234 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W IRC22P40006 225 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PET130P47065 347 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W MDM34P53083 459 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PNC1P53184 216 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PAU12P53343 120 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W ACT1P60010 375 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W GMC1Q04399 608 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W ATG10Q07879 167 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PET20Q99373 253 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W HKR1P41809 1802 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W COX5AP00424 153 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W DDI2P0CH63 225 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W DDI3P0CH64 225 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PAU2P32612 120 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W MGM101P32787 269 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YCR041WP37265 110 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W MRPS9P38120 278 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W FIG1P38224 298 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YBR096WP38256 230 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YBR220CP38318 560 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W RPS20P38701 121 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W GPI16P38875 610 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W SPC25P40014 221 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W HMF1P40037 129 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W LYS12P40495 371 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W ICE2P40499 491 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W AVT7P40501 490 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W IBA57P47158 497 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W MIC26P50087 233 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W MTM1P53320 366 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YNR066CP53752 436 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W ELP6Q04868 273 aa2.28□□□□□ -2.04
YKR078WYKR078W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62.2 ms