RNA–Protein interactions for RNA: YJL024C

APS3, Transcript of Small subunit of the clathrin-associated adaptor complex AP-3, yeast

Gene APS3, Length 585 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APS3	YJL024C	QCR2	P07257	368 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SPS100	P13130	326 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	CKA1	P15790	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	DAL80	P26343	269 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SYG1	P40528	902 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	MRPL22	P53881	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TSA2	Q04120	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	FCY22	Q12119	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	FMP16	Q12497	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	PRM4	Q12498	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ATG40	Q99325	256 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RPL39	P04650	51 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ERG2	P32352	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	MNS1	P32906	549 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YKL069W	P36088	180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ALG14	P38242	237 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YIR035C	P40579	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YNL092W	P53934	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	CAC2	Q04199	468 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ASM4	Q05166	528 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YCT1	Q12235	531 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RTR2	Q12378	196 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	MRS4	P23500	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	MRP20	P32387	263 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	LAG1	P38703	411 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ECM14	P38836	430 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	VMA7	P39111	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	PAC2	P39937	518 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	BMT5	P40493	336 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TAD2	P47058	250 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	JAC1	P53193	184 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	PEF1	P53238	335 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	FIT1	Q04433	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ANT1	Q06497	328 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RRT7	Q07829	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	BBP1	Q12365	385 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	PDC2	P32896	925 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SPC29	P33419	253 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YKL187C	P34231	750 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YUH1	P35127	236 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YBR184W	P38299	523 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SWM2	P40342	146 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	IRC24	P40580	263 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YHC3	P47040	408 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SNX4	P47057	423 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	BNA2	P47125	453 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YNL046W	P53956	172 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	HSK3	P69852	69 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	VPS28	Q02767	242 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RIM9	Q04734	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SNA4	Q07549	140 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SWT1	Q12104	458 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ATG31	Q12421	196 aa		4.78	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	MRP10	O75012	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APS3	YJL024C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
APS3	YJL024C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
APS3	YJL024C	SRY1	P36007	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APS3	YJL024C	GAT2	P40209	560 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APS3	YJL024C	SLM1	P40485	686 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APS3	YJL024C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
APS3	YJL024C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
APS3	YJL024C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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