RNA–Protein interactions for RNA: YHR145C

YHR145C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YHR145C, Length 357 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR145C	YHR145C	YIL177C	P40434	1758 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	YJL225C	P40889	1758 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	YPR096C	O13587	100 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	MRS1	P07266	363 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	MIG1	P27705	504 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	GIM5	Q04493	163 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	AKR2	Q12013	749 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	YGR050C	P53231	118 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	CCA1	P21269	546 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	VPS51	P36116	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	ECM4	P36156	370 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	POG1	P40473	351 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	QCR6	P00127	147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	CDC8	P00572	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	PUT1	P09368	476 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	DSK2	P48510	373 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	PRM15	Q03262	622 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	SIR2	P06700	562 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	COG5	P53951	403 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	SNO1	Q03144	224 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YHR145C	YHR145C	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	FAB1	P34756	2278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	YHL026C	P38740	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	SRP14	P38985	146 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	SPO73	P40031	143 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	YJL144W	P47009	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	CAB4	P53332	305 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	PSF1	Q12488	208 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	MHT1	Q12525	324 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	MSW1	P04803	379 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
YHR145C	YHR145C	TRX3	P25372	127 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	SNX4	P47057	423 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	NRK1	P53915	240 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	GRX8	Q05926	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	SCM4	P32564	187 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	GLE2	P40066	365 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	YIP3	P53633	176 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	APJ1	P53940	528 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	FUS2	Q05670	677 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	SDH4	P37298	181 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	CTR2	P38865	189 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	SUE1	Q06524	206 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	REP2	P03872	296 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	BET1	P22804	142 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	MNN5	P46982	586 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	YNL184C	P53876	108 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	SLM2	P53955	656 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	ARO80	Q04052	950 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	TRM12	Q04235	462 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	GGA1	Q06336	557 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	SNF4	P12904	322 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	AIF1	P52923	378 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YHR145C	YHR145C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	SEC17	P32602	292 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	TSC3	Q3E790	80 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	YJR146W	P47174	117 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	SWP1	Q02795	286 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	MCP1	Q12106	302 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	MRPS28	P21771	286 aa		4	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	YLR460C	P54007	376 aa		4	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	ATO3	Q12359	275 aa		4	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	MED6	P38782	295 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YHR145C	YHR145C	MIX17	Q03667	156 aa		3.99	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21 ms