RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W SRY1P36007 326 aa7.05□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W IKI1P38874 309 aa7.05□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W BMT5P40493 336 aa7.05□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W DIE2P50076 525 aa7.05□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W ACT1P60010 375 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W RBD2Q12270 262 aa7.05□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W PET54P10834 293 aa7.04□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W STF2P16965 84 aa7.04□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W IFM1P25038 676 aa7.04□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W MRP20P32387 263 aa7.04□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W BNA6P43619 295 aa7.04□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W YDR286CQ05530 114 aa7.04□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W AEP3Q12089 606 aa7.04□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W GAL1P04385 528 aa7.03□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W YUH1P35127 236 aa7.03□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W GET2P40056 285 aa7.03□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W ECM27P47144 725 aa7.03□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W MAK3Q03503 176 aa7.03□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W MSC3Q05812 728 aa7.03□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W ODC2Q99297 307 aa7.03□□□□□ -1.28
CPD1YGR247W MET17P06106 444 aa7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W HIS3P06633 220 aa7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W GRX2P17695 143 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W RFC2P40348 353 aa7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W SYG1P40528 902 aa7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YJL163CP46996 555 aa7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W ERG25P53045 309 aa7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W IMO32P53219 342 aa7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W CWC25P53854 179 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YMR130WQ04223 302 aa7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YOR292CQ08743 309 aa7.02□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W AAC1P04710 309 aa7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W ERV1P27882 189 aa7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W HYM1P32464 399 aa7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W AGA2P32781 87 aa7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YBR197CP38306 217 aa7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W FCY21P40039 528 aa7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W PCL7P40186 285 aa7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W SCW10Q04951 389 aa7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W GPN3Q06543 272 aa7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YLR365WQ7LIF2 110 aa7.01□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W URA3P03962 267 aa7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W CHO1P08456 276 aa7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W CDC34P14682 295 aa7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W URA6P15700 204 aa7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YKR045CP36138 183 aa7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W RTT105P40063 208 aa7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W COX15P40086 486 aa7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W ALG9P53868 555 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W ASM4Q05166 528 aa7□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YMR31P19955 123 aa6.99□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W ROX3P25046 220 aa6.99□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W GEP4P38812 185 aa6.99□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YIL060WP40519 144 aa6.99□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W IMD3P50095 523 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W VHT1P53241 593 aa6.98□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W MRPL22P53881 309 aa6.98□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YDR274CP87283 123 aa6.98□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W GRX3Q03835 250 aa6.98□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa6.98□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W CKA1P15790 372 aa6.97□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W MPC2P38857 129 aa6.97□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W YJR012CP47087 207 aa6.97□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W CAB5Q03941 241 aa6.97□□□□□ -1.29
CPD1YGR247W HTB1P02293 131 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W MRS4P23500 304 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W RIB7P33312 244 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W PCL6P40038 420 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W YNL194CP40169 301 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W UBP8P50102 471 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W TDA1Q03533 586 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W RCF1Q03713 159 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W YDR179W-AQ03983 463 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W TSA2Q04120 196 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W TDA6Q06466 467 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W YFH1Q07540 174 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W YOL029CQ08187 201 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W ATG41Q12048 136 aa6.96□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W MED8P38304 223 aa6.95□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W YGR042WP53227 271 aa6.95□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W CRH1P53301 507 aa6.95□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W SOG2Q08817 791 aa6.95□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W RKI1Q12189 258 aa6.95□□□□□ -1.3
CPD1YGR247W BOL1Q3E793 110 aa6.95□□□□□ -1.3
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