RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	YCR101C	P25607	182 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	SNC2	P33328	115 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	YKL063C	P35725	167 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	SWD3	P38123	315 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	MPC2	P38857	129 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	PHM8	P40025	321 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	BUD8	P41698	603 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	FIT1	Q04433	528 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	NDE2	Q07500	545 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	HEM25	Q07534	307 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	NRG2	P38082	220 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	UMP1	P38293	148 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	YFR035C	P43608	114 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	SOL1	P50278	321 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	TDA1	Q03533	586 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	FIN1	Q03898	291 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	SPC24	Q04477	213 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	TFC7	Q12415	435 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SYF2	YGR129W	MRS4	P23500	304 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YBR285W	P38354	144 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YHK8	P38776	514 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YAP1802	P53309	568 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	COG5	P53951	403 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YPD1	Q07688	167 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	AEP3	Q12089	606 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	TAF3	Q12297	353 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	DIF1	O13577	133 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	COX9	P07255	59 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	HYM1	P32464	399 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	SPS18	P32572	300 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YKR045C	P36138	183 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	SRL3	P36167	246 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	COX15	P40086	486 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	BMT5	P40493	336 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YGR210C	P42942	411 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YPR1	Q12458	312 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	ARO7	P32178	256 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	GWT1	P47026	490 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YJR012C	P47087	207 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	ATG17	Q06410	417 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	ASR1	Q06834	288 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	FUN26	P31381	517 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	ERG25	P53045	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	CRH1	P53301	507 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	PAU12	P53343	120 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	HLR1	Q04429	423 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	DGK1	Q12382	290 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	ROX3	P25046	220 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YBL010C	P32788	280 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	PDC2	P32896	925 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	VAM7	P32912	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YNL194C	P40169	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	RFC2	P40348	353 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	FMC1	P40491	155 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YJR120W	P47157	116 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	CKA1	P15790	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	PAU24	P38155	120 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	SSO2	P39926	295 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	PAM16	P42949	149 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	BUD25	P85052	153 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	INP53	Q12271	1107 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	RPN13	O13563	156 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	GAL1	P04385	528 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	PET18	P25362	215 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	LSB5	P25369	354 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	ERG3	P32353	365 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	SRY1	P36007	326 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF2	YGR129W	GEP4	P38812	185 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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