RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	PGD1	P40356	397 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	BIR1	P47134	954 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ILM1	P47155	203 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YGR050C	P53231	118 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YML122C	Q03207	126 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	TRM12	Q04235	462 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	PRR2	Q12310	699 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	CDC7	P06243	507 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	LDS1	P31379	325 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	CSH1	P38287	376 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YHI9	P38765	294 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	VMA7	P39111	118 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	TIM17	P39515	158 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	OST2	P46964	130 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	FMP48	P53233	369 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	TIM13	P53299	105 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	RNH201	P53942	307 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YOR342C	Q12182	319 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YPR011C	Q12251	326 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	SFC1	P33303	322 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	SMP1	P38128	452 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	MED6	P38782	295 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ORM1	P53224	222 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YMR253C	Q04835	414 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YOR376W	Q08900	122 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	TSC3	Q3E790	80 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	DDI2	P0CH63	225 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	DDI3	P0CH64	225 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	SPO13	P23624	291 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	STP22	P25604	385 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.3	□□□□□ -1.88	not detected
SLX8	YER116C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	MRPL17	P36528	281 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	PHO89	P38361	574 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YPL073C	P40323	161 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YIL024C	P40543	189 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YGR219W	P53307	113 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	HHO1	P53551	258 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	CWC27	Q02770	301 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	GAS3	Q03655	524 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	THI74	Q04083	370 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YMR254C	Q04838	102 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	CNL1	Q06333	122 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	AYT1	Q12226	474 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	IES3	Q12345	250 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ATP14	Q12349	124 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	CNB1	P25296	175 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ATS1	P31386	333 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	MRP49	P32388	137 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	AYR1	P40471	297 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	CFD1	P40558	293 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	SNO3	P43544	222 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	CLD1	P53264	445 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	WSC2	P53832	503 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	PGA1	P53896	198 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	SAE3	P89114	91 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	APS2	Q00381	147 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	VHS1	Q03785	461 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	FMP42	Q04991	504 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	MRX8	Q05473	314 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	NKP2	Q06162	153 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	FCY1	Q12178	158 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	BUD4	P47136	1447 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ATR1	P13090	542 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	ERG2	P32352	222 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	GGC1	P38988	300 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	DLS1	P40366	167 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88

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