RNA–Protein interactions for RNA: YBL093C

ROX3, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene ROX3, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROX3	YBL093C	YGR210C	P42942	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	SSN8	P47821	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	UFD1	P53044	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	NIF3	P53081	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	YIP5	P53108	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	GIM3	P53900	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	YML018C	Q03730	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	YNG1	Q08465	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
ROX3	YBL093C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	MSI1	P13712	422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	ERG3	P32353	365 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	MCH2	P36032	473 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	POP8	P38208	133 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	FIG1	P38224	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	YPC1	P38298	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	YFL051C	P43552	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	SIP18	P50263	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ROX3	YBL093C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	MAK32	P23060	363 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	SUA5	P32579	426 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	CLB6	P32943	380 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YHL037C	P38733	133 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
ROX3	YBL093C	PHM8	P40025	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YIL029C	P40538	142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	ECM27	P47144	725 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	PRM15	Q03262	622 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	FEX2	Q08991	375 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	UBA3	Q99344	299 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	REP2	P03872	296 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	SPS4	P09937	338 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	SEN2	P16658	377 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YCR101C	P25607	182 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	OCH1	P31755	480 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	EGT2	P42835	1041 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	UBP8	P50102	471 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	THI74	Q04083	370 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	RTT103	Q05543	409 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	SCP1	Q08873	200 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	FRE8	Q12209	686 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	RTR2	Q12378	196 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	EAF3	Q12432	401 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	FMP16	Q12497	93 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	BPH1	P25356	2167 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	SEC22	P22214	214 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	RPB7	P34087	171 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	GPI16	P38875	610 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	POP2	P39008	433 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	VMA7	P39111	118 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	MRX5	P47007	382 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	SNX4	P47057	423 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YDC1	Q02896	317 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	CAB5	Q03941	241 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	PIN3	Q06449	215 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	GRC3	Q07845	632 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	FEX1	Q08913	375 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	COX17	Q12287	69 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	CRC1	Q12289	327 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	RNH203	Q12338	110 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	MED4	Q12343	284 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	BBP1	Q12365	385 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	TFC7	Q12415	435 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	PRM4	Q12498	284 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	MEC1	P38111	2368 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	IMP1	P28627	190 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	MRP20	P32387	263 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	YOX1	P34161	385 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	SWD3	P38123	315 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	SWM2	P40342	146 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ROX3	YBL093C	TAD2	P47058	250 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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