RNA–Protein interactions for RNA: YOL073C

DSC2, Transcript of Multi-transmembrane subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene DSC2, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSC2	YOL073C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
DSC2	YOL073C	YER184C	P39961	794 aa		3.41	□□□□□ -1.86
DSC2	YOL073C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
DSC2	YOL073C	GAT3	Q07928	141 aa		3.41	□□□□□ -1.86
DSC2	YOL073C	JLP1	Q12358	412 aa		3.41	□□□□□ -1.86
DSC2	YOL073C	HMS1	Q12398	434 aa		3.41	□□□□□ -1.86
DSC2	YOL073C	YOR343C	Q12484	108 aa		3.41	□□□□□ -1.86
DSC2	YOL073C	CMK2	P22517	447 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	TOA1	P32773	286 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MDL1	P33310	695 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YKL071W	P36086	256 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YBR241C	P38142	488 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YGR201C	P42936	225 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YDR391C	Q04170	232 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	CTS2	Q06350	511 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	BTS1	Q12051	335 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	APC2	Q12440	853 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MRPS28	P21771	286 aa		3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MIG1	P27705	504 aa		3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	TIM12	P32830	109 aa		3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	TIR2	P33890	251 aa		3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	LTV1	P34078	463 aa		3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	NUP57	P48837	541 aa		3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YDR102C	Q03864	110 aa		3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YPR127W	Q06494	345 aa		3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	ASA1	Q06822	443 aa		3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RRT8	Q08219	342 aa		3.39	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RAD7	P06779	565 aa		3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YPK2	P18961	677 aa		3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	PTC1	P35182	281 aa		3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RBG1	P39729	369 aa		3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	TOS2	P50078	622 aa		3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YDC1	Q02896	317 aa		3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	DSF1	P0CX08	502 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MRPL17	P36528	281 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MLH1	P38920	769 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	AGE2	P40529	298 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	DML1	Q03652	475 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	FMN1	Q03778	218 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	SPO77	Q06134	477 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	NSL1	Q12143	216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.36	□□□□□ -1.87	not detected
DSC2	YOL073C	RPL39	P04650	51 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	ECT1	P33412	323 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	PEX22	P39718	180 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	PMT5	P52867	743 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	BRR6	P53062	197 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	GPI17	Q04080	534 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MSC3	Q05812	728 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MCT1	Q12283	360 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
DSC2	YOL073C	RCY1	P39531	840 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	FLX1	P40464	311 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	VHT1	P53241	593 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RRN9	P53437	365 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YNR062C	P53748	327 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YPL067C	Q02754	198 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MIM1	Q08176	113 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	LDS2	Q08218	356 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YOL131W	Q08270	108 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MHF2	Q3E829	80 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	SUR1	P33300	382 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	PEX32	P38292	413 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YGL235W	P53071	178 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	VPS71	Q03433	280 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	BNA7	Q04066	261 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	FAR8	Q05040	523 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	YPR098C	Q06089	161 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	ARR2	Q06597	130 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	PRM7	Q12459	698 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DSC2	YOL073C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87

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