RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W TMA10Q06177 86 aa2.34□□□□□ -2.04
YML039WYML039W FRQ1Q06389 190 aa2.34□□□□□ -2.04
YML039WYML039W FUR4P05316 633 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W DPM1P14020 267 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W OAC1P32332 324 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W PRY2P36110 329 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W UTP30P36144 274 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YHR177WP38867 453 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W POP2P39008 433 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YIL169CP40442 995 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W AIM11P87275 137 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YPK2P18961 677 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W CPR2P23285 205 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RPS2P25443 254 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W HOM6P31116 359 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W THI2P38141 450 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W SAD1P43589 448 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W NCE101Q02820 53 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YMR187CQ03236 431 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W GTO3Q04806 366 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YOR186WQ08560 144 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W PST2Q12335 198 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YLR111WQ12528 110 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RIB3Q99258 208 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W CDC20P26309 610 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YKL077WP36081 392 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W CSH1P38287 376 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W STP2P38704 541 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W ECM34P38728 170 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W SSN8P47821 323 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W TVP18Q04767 167 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YPR071WQ12346 211 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W NDC1P32500 655 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W ALG14P38242 237 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W AIM2P39721 246 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W MID1P41821 548 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W LOA1Q06508 300 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YCT1Q12235 531 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W SAL1D6W196 494 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YIL086CP40503 102 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YNL165WP53891 406 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YCL021W-AQ96VH3 125 aa2.33□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RPB3P16370 318 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W ERS1P17261 260 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W DBR1P24309 405 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RHB1P25378 209 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W NTG1P31378 399 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YPT32P51996 222 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YMR209CQ03648 457 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W HOR7Q05827 59 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W CDC7P06243 507 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YUH1P35127 236 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W MRPL3P36516 390 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W VPS55P47111 140 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YGL159WP53110 370 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W APS2Q00381 147 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W YOL019WQ08157 551 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W HRT1Q08273 121 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W MED11Q99278 115 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W GAL1P04385 528 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W TRX3P25372 127 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W POF1P25576 258 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W MRP17P28778 131 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W ISF1P32488 338 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W UTH1P36135 365 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W MED8P38304 223 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RPB11P38902 120 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W FLX1P40464 311 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W HXT10P43581 546 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W IMD3P50095 523 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W NUP49Q02199 472 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W SYM1Q06563 197 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W PFA4Q12006 378 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W RAD28Q12021 506 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W LAS17Q12446 633 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W HUT1Q12520 339 aa2.32□□□□□ -2.04
YML039WYML039W BNI1P41832 1953 aa2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 1009.6 ms