RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W VMA6P32366 345 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W RAD23P32628 398 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YBL010CP32788 280 aa7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W FLO10P36170 1169 aa7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W SWD3P38123 315 aa7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W SOH1P38633 127 aa7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W EFM3P47163 339 aa7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YML122CQ03207 126 aa7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YLR281CQ05863 155 aa7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W MCH1Q07376 486 aa7.19□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YLL053CP0CD98 152 aa7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W ATR1P13090 542 aa7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W ARO4P32449 370 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W PAU24P38155 120 aa7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W UMP1P38293 148 aa7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W NOP16P40007 231 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W SNL1P40548 159 aa7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W SRL4Q03085 281 aa7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W FIT1Q04433 528 aa7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YLR346CQ06139 101 aa7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YOL118CQ08259 102 aa7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W TFC7Q12415 435 aa7.18□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W COX9P07255 59 aa7.17□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W CCS1P40202 249 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YJL213WP40896 331 aa7.17□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W HNT2P49775 206 aa7.17□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W NEJ1Q06148 342 aa7.17□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W ATG17Q06410 417 aa7.17□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W AEP3Q12089 606 aa7.17□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W AVT6P40074 448 aa7.16□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W SYG1P40528 902 aa7.16□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W FMP33P46998 180 aa7.16□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W TOS8P53147 276 aa7.16□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W VAM7P32912 316 aa7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W AST1P35183 429 aa7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YBR285WP38354 144 aa7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W GET2P40056 285 aa7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W SCW4P53334 386 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W SCW10Q04951 389 aa7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W SWT1Q12104 458 aa7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YOS1Q3E834 85 aa7.15□□□□□ -1.26
YLR349WYLR349W YLR358CO13565 187 aa7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W TDH1P00360 332 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W FUR4P05316 633 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W MRS4P23500 304 aa7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W ERG3P32353 365 aa7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W PHM8P40025 321 aa7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W GWT1P47026 490 aa7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W SKP1P52286 194 aa7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W PRM3Q08931 133 aa7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W STF2P16965 84 aa7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YCR101CP25607 182 aa7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W GAR1P28007 205 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W ERG24P32462 438 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YKL075CP36083 450 aa7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W SSO2P39926 295 aa7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YJL118WP47022 219 aa7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W IMD3P50095 523 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W BUD25P85052 153 aa7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YHP1Q04116 353 aa7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YPD1Q07688 167 aa7.13□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W UTR5P32630 166 aa7.12□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W GPP2P40106 250 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W CAB4P53332 305 aa7.12□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W NDE2Q07500 545 aa7.12□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YPL199CQ08954 240 aa7.12□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W RPS31P05759 152 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W PET18P25362 215 aa7.11□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W PAU2P32612 120 aa7.11□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W AGA2P32781 87 aa7.11□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W REC104P33323 182 aa7.11□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W SDH4P37298 181 aa7.11□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W CWC25P53854 179 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YMR181CQ03231 154 aa7.11□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YLR099W-AQ3E798 87 aa7.11□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W ERV1P27882 189 aa7.1□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W ARO7P32178 256 aa7.1□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W SFK1P35735 353 aa7.1□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W EGD2P38879 174 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W OCH1P31755 480 aa7.09□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YHK8P38776 514 aa7.09□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W ERP6P53198 216 aa7.09□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W MRPL13Q02204 264 aa7.09□□□□□ -1.27
YLR349WYLR349W YKR045CP36138 183 aa7.08□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W YOL029CQ08187 201 aa7.08□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data7.07□□□□□ -1.28not detected
YLR349WYLR349W FAR1P21268 830 aa7.07□□□□□ -1.28
YLR349WYLR349W PRE7P23724 241 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 105.6 ms