RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	SBH2	P52871	88 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SDS23	P53172	527 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	GRX8	Q05926	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	ECM13	P38195	257 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YIL067C	P40514	678 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	CRH1	P53301	507 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	GOT1	Q03554	138 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YML096W	Q04489	525 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	GCN3	P14741	305 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	IMP1	P28627	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SDH3	P33421	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	MRPL28	P36527	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	DER1	P38307	211 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YHL049C	P38722	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YFH7	P43591	353 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	ABF2	Q02486	183 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SDC1	Q03323	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	LOA1	Q06508	300 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	HRT3	Q12347	344 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	JID1	Q12350	301 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	AGC1	Q12482	902 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	ECM29	P38737	1868 aa		4.09	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	SWI1	P09547	1314 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	PRY2	P36110	329 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	FRM2	P37261	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	ICE2	P40499	491 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YIL012W	P40551	113 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YJR054W	P47114	497 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	TOS8	P53147	276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YGR015C	P53208	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YGR018C	P53211	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	RNH201	P53942	307 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	LIP2	Q06005	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	MDM32	Q12171	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	MET2	P08465	486 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	TRX3	P25372	127 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	OAC1	P32332	324 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	CSE2	P33308	149 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YER076C	P40049	302 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	STB1	P42845	420 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	PRM10	P42946	383 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	ATG18	P43601	500 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	IZH2	Q12442	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YCR025C	P25352	136 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YEL045C	P32616	141 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YBL059W	P34224	193 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	SRY1	P36007	326 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	SOL2	P37262	315 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YER186C	P40101	306 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	BNS1	P50084	137 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	MRH4	P53166	561 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	NUP49	Q02199	472 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	MGT1	P26188	188 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	APS1	P35181	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	POP8	P38208	133 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	PHO89	P38361	574 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	EFM1	P38732	585 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YFL064C	P43540	174 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YDC1	Q02896	317 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKR104W	YKR104W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.8 ms