RNA–Protein interactions for RNA: YJL024C

APS3, Transcript of Small subunit of the clathrin-associated adaptor complex AP-3, yeast

Gene APS3, Length 585 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APS3	YJL024C	GAT3	Q07928	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PET122	P10355	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	SEN2	P16658	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	OCH1	P31755	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ACB1	P31787	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	FAT1	P38225	669 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PIG2	P40187	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	EGT2	P42835	1041 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YGR210C	P42942	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	UBC13	P52490	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ACS1	Q01574	713 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YDC1	Q02896	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PIN3	Q06449	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	FEX2	Q08991	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	EAF3	Q12432	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	GAL1	P04385	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	IMP1	P28627	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	SUA5	P32579	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	DUT1	P33317	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YOX1	P34161	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YBR220C	P38318	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
APS3	YJL024C	TOK1	P40310	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	MRX5	P47007	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	UBP8	P50102	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	MRPL50	P53724	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	SCP1	Q08873	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	UBA3	Q99344	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	GEP4	P38812	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	SIT1	P39980	628 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	TAF4	P50105	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	PLP1	Q04004	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	RTT103	Q05543	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	GRC3	Q07845	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YNG1	Q08465	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	FEX1	Q08913	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	MED4	Q12343	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APS3	YJL024C	NUM1	Q00402	2748 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SPS4	P09937	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YCR101C	P25607	182 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YCR061W	P25639	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RPB7	P34087	171 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YKL107W	P34251	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	NAT2	P37293	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SWD3	P38123	315 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YPC1	P38298	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	LNP1	P38878	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	GNP1	P48813	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	HNT2	P49775	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	CRZ1	P53968	678 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SKO1	Q02100	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	CAB5	Q03941	241 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	THI74	Q04083	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YOL118C	Q08259	102 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	FRE8	Q12209	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SEC22	P22214	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	COS8	P38723	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	POP2	P39008	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	RMD6	P39975	231 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	PHM8	P40025	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	PRM5	P40476	318 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	GON7	P46984	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ECM27	P47144	725 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SOL1	P50278	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	SED1	Q01589	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	PRM15	Q03262	622 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	UPS1	Q05776	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	ORM2	Q06144	216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	VAM3	Q12241	283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	TFC7	Q12415	435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
APS3	YJL024C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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