RNA–Protein interactions for RNA: YHR106W

TRR2, Transcript of Mitochondrial thioredoxin reductase, yeast

Gene TRR2, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRR2	YHR106W	SPS18	P32572	300 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	RIB7	P33312	244 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	PRY2	P36110	329 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	ALG14	P38242	237 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	APJ1	P53940	528 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	HSK3	P69852	69 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	SRL4	Q03085	281 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	KEI1	Q06346	221 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	DGK1	Q12382	290 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	RAX2	Q12465	1220 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	CDC34	P14682	295 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	OCH1	P31755	480 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	YBL010C	P32788	280 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	VAM7	P32912	316 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	FLO10	P36170	1169 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	BMT5	P40493	336 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	YIL060W	P40519	144 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	YJL118W	P47022	219 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	YGR045C	P53229	120 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	BUD25	P85052	153 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	STD1	Q02794	444 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	MGR3	Q04472	501 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	SRL1	Q08673	210 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	NKP1	Q12493	238 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	ODC2	Q99297	307 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	URA3	P03962	267 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	PRE4	P30657	266 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	MTC7	P32633	139 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	SWD3	P38123	315 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	SOL1	P50278	321 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	MIX17	Q03667	156 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	YDR286C	Q05530	114 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	TMA10	Q06177	86 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	INP53	Q12271	1107 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TRR2	YHR106W	PET54	P10834	293 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	ERG3	P32353	365 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	AIM20	P40451	204 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	FMP48	P53233	369 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YMR166C	Q03829	368 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	FIT1	Q04433	528 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YPR071W	Q12346	211 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	GAL1	P04385	528 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	COQ2	P32378	372 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	MRP20	P32387	263 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YUH1	P35127	236 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YBR197C	P38306	217 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	FCY21	P40039	528 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	OTU1	P43558	301 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YFL015C	P43578	164 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	TAX4	P47030	604 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	ERV29	P53337	310 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	PHO85	P17157	305 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	AGA2	P32781	87 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	RPB7	P34087	171 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	PMU1	P36069	295 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	EDS1	P38073	919 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	MRPL22	P53881	309 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	MCM21	Q06675	368 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	ERG2	P32352	222 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	CUE1	P38428	203 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YFL054C	P43549	646 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	IRC18	P47056	224 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	DAL4	Q04895	635 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	ASM4	Q05166	528 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YPD1	Q07688	167 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	PEX27	Q08580	376 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YOR292C	Q08743	309 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YOR385W	Q08909	290 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	ADE8	P04161	214 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	YLL053C	P0CD98	152 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TRR2	YHR106W	IKI1	P38874	309 aa		5.79	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.6 ms