RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 CNTN3Q9P232 1028 aa33.11■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 CEP250Q9BV73 2442 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 WDR27A2RRH5 827 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 E9PMD0 336 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 SYN3O14994 580 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 NEFLP07196 543 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 MCF2P10911 925 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 YARSP54577 528 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 IL17AQ16552 155 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF568Q3ZCX4 644 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 C1orf186Q6ZWK4 172 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 BORCS6Q96GS4 357 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 DNM3Q9UQ16 869 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa33.1■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 PODXLO00592 558 aa33.09■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 HIP1RO75146 1068 aa33.09■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 ATF2P15336 505 aa33.09■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 PRSS36Q5K4E3 855 aa33.09■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 RINT1Q6NUQ1 792 aa33.09■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 TCEAL8Q8IYN2 117 aa33.09■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 RAB34Q9BZG1 259 aa33.09■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 F5P12259 2224 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 SHISA7A6NL88 538 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC169A6NNP5 214 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 LAD1O00515 517 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 RPL9P32969 192 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 PRPHP41219 470 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 MAGEA9P43362 315 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 ERICH6BQ5W0A0 696 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 KCNG4Q8TDN1 519 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 CLDN23Q96B33 292 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 DRC1Q96MC2 740 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 KIF2CQ99661 725 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 RUSC1Q9BVN2 902 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 LTB4R2Q9NPC1 389 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 FBXO4Q9UKT5 387 aa33.08■■■□□ 2.89
ALYREF-202ENST00000505490 MICAL2O94851 1124 aa33.07■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 PTPN2P17706 415 aa33.07■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 KCNK18Q7Z418 384 aa33.07■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 SUMF1Q8NBK3 374 aa33.07■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 ING5Q8WYH8 240 aa33.07■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 ACAP3Q96P50 834 aa33.07■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 BCO2Q9BYV7 579 aa33.07■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa33.07■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 KMT5AQ9NQR1 393 aa33.07■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 MPZL3Q6UWV2 235 aa33.06■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 TIPINQ9BVW5 301 aa33.06■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 MYH11P35749 1972 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 PP2D1A8MPX8 630 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 FCARP24071 287 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 GUCY2CP25092 1073 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 OSTNP61366 133 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 HYIQ5T013 277 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 KRT79Q5XKE5 535 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 FAM184AQ8NB25 1140 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 SPIRE2Q8WWL2 714 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 NELL1Q92832 810 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 ELSPBP1Q96BH3 223 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 MCRS1Q96EZ8 462 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 SUSD3Q96L08 255 aa33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 FAM170BA6NMN3 283 aa33.04■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 SEC24AO95486 1093 aa33.04■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 CEBPBP17676 345 aa33.04■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 FZD5Q13467 585 aa33.04■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 TPGS2Q68CL5 300 aa33.04■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 KCTD17Q8N5Z5 321 aa33.04■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 KCNN1Q92952 543 aa33.04■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 NELL2Q99435 816 aa33.04■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 FBXL5Q9UKA1 691 aa33.04■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 COL4A2P08572 1712 aa33.04■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 H7C4K7 107 aa33.03■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 CDC25AP30304 524 aa33.03■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 TANGO2Q6ICL3 276 aa33.03■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 RUBCNQ92622 972 aa33.03■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 MAFFQ9ULX9 164 aa33.03■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 LRG1P02750 347 aa33.02■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 RPS9P46781 194 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 UBXN2BQ14CS0 331 aa33.02■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 SLC10A6Q3KNW5 377 aa33.02■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF687Q8N1G0 1237 aa33.02■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 DNASE1L2Q92874 299 aa33.02■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 RMDN1Q96DB5 314 aa33.02■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 INSL5Q9Y5Q6 135 aa33.02■■■□□ 2.88
ALYREF-202ENST00000505490 SLC16A4O15374 487 aa33.01■■■□□ 2.87
ALYREF-202ENST00000505490 TOM1L1O75674 476 aa33.01■■■□□ 2.87
ALYREF-202ENST00000505490 CD72P21854 359 aa33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms