RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, human

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX17-208	ENST00000493711	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	DGKI	O75912	1065 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	GJB5	O95377	273 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	FGFR1	P11362	822 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	MXI1	P50539	228 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	LRRC43	Q8N309	656 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	RAD9A	Q99638	391 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	NDST4	Q9H3R1	872 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	PTGES	O14684	152 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	PHACTR2	O75167	634 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	UPP2	O95045	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	NFIC	P08651	508 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	PNPLA4	P41247	253 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	FMO5	P49326	533 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	SCNN1G	P51170	649 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	DEFB103A	P81534	67 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	FANCC	Q00597	558 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TUSC3	Q13454	348 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	ZACN	Q401N2	412 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	SARM1	Q6SZW1	724 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TAF4B	Q92750	862 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	CASD1	Q96PB1	797 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	LRPAP1	P30533	357 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	ATIC	P31939	592 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	GCLM	P48507	274 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	UBASH3A	P57075	661 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	DLG4	P78352	724 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	RBP5	P82980	135 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	MYL7	Q01449	175 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	BIRC3	Q13489	604 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TRPC3	Q13507	836 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711		A0A1B0GTH6	734 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	POMC	P01189	267 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	DSC1	Q08554	894 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNX17-208	ENST00000493711	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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