RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL204CP53089 101 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR054WP53235 642 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P OKP1P53298 406 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P CWC25P53854 179 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL234WP53857 426 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P HSK3P69852 69 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P SRL4Q03085 281 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P TLG1Q03322 224 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P MDM36Q06820 579 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR186WQ08560 144 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR071WQ12346 211 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P JID1Q12350 301 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ATO3Q12359 275 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ORT1Q12375 292 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P WHI5Q12416 295 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YOS1Q3E834 85 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG40Q99325 256 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P VCX1Q99385 411 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P GCN4P03069 281 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD52P06778 471 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO85P17157 305 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P VMA3P25515 160 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P BUD23P25627 275 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P AHC2P25649 128 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ARO4P32449 370 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ERG24P32462 438 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P SFK1P35735 353 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P EDS1P38073 919 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P CCZ1P38273 704 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P NVJ1P38881 321 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P PDS1P40316 373 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P MSS2P40990 351 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P BUD8P41698 603 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P FIP1P45976 327 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P MRX5P47007 382 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P TAX4P47030 604 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ILM1P47155 203 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P XPT1P47165 209 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P DOC1P53068 250 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P SCW4P53334 386 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS71Q03433 280 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P FIT1Q04433 528 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P GRC3Q07845 632 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL118CQ08259 102 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P AEP3Q12089 606 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P RBD2Q12270 262 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR122CQ12312 125 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P FRE6Q12473 712 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P DYN1P36022 4092 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ADE8P04161 214 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC31P06704 161 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P COX9P07255 59 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P MATALPHA1P0CY06 175 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P HMLALPHA1P0CY07 175 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P MRP1P10662 321 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P MRS4P23500 304 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG22P25568 528 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ERG3P32353 365 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P RPD3P32561 433 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P PAU2P32612 120 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ISC10P32645 267 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P SOR1P35497 357 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P PRY2P36110 329 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P CUE1P38428 203 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P PRS2P38620 318 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P PRE3P38624 215 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YLF2P38746 405 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P TIF11P38912 153 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P MID1P41821 548 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P GNA1P43577 159 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P GPI14P47088 403 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P BNA1P47096 177 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P EFM3P47163 339 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P BXI1P48558 297 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P IMO32P53219 342 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR042WP53227 271 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P SLX9P53251 210 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P CTF19Q02732 369 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P HED1Q03937 162 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P UPS1Q05776 175 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P NDE2Q07500 545 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL086WQ07505 273 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P SOR2Q07786 357 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P SWT1Q12104 458 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P TAF3Q12297 353 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM10Q12400 293 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P MED11Q99278 115 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P ODC2Q99297 307 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS31P05759 152 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P HIS3P06633 220 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)PtW(CCA)P MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data2.11□□□□□ -2.07not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P OLE1P21147 510 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71.7 ms