RNA–Protein interactions for RNA: YEL038W

UTR4, Transcript of Protein with sequence similarity to acireductone synthases, yeast

Gene UTR4, Length 684 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTR4	YEL038W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	TAT1	P38085	619 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ALG14	P38242	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	DLS1	P40366	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SYS1	P41544	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YIP4	P53093	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	FMP48	P53233	369 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	MRPL50	P53724	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SAM50	P53969	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	CTF19	Q02732	369 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SDC1	Q03323	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	MIX14	Q04341	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ASM4	Q05166	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	COA4	Q05809	96 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	GAS2	Q06135	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ORM2	Q06144	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	GRE1	Q08969	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	PRB1	P09232	635 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SPS100	P13130	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SPO7	P18410	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SNC2	P33328	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	FRM2	P37261	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	APD1	P38281	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
UTR4	YEL038W	SLZ1	P40167	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YIL060W	P40519	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YGR042W	P53227	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SLI1	P53304	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	AAH1	P53909	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	BUD25	P85052	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	PLP1	Q04004	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	HEM25	Q07534	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
UTR4	YEL038W	RDI1	Q12434	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	RRI1	Q12468	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ODC2	Q99297	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	FSH3	Q99369	266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	BPH1	P25356	2167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YLR358C	O13565	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SGA1	P08019	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	CHO1	P08456	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	UTR1	P21373	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	MDH2	P22133	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	PET18	P25362	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ERV1	P27882	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SYG1	P40528	902 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	OTU1	P43558	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	MSY1	P48527	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	POP6	P53218	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	FLO9	P39712	1322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	NAM2	P11325	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	HXT2	P23585	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	APL3	P38065	1025 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	AVT7	P40501	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	PRY1	P47032	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	LOH1	P47055	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	BXI1	P48558	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	COX18	P53239	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	RSM27	P53305	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	NRK1	P53915	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	VBA1	Q04301	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YNG1	Q08465	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	FRE3	Q08905	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	TGS1	Q12052	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	DYN1	P36022	4092 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ARG80	P07249	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	URA6	P15700	204 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	PCL1	P24867	279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	UMP1	P38293	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	CIN2	P46670	268 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTR4	YEL038W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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