RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 MTFR1LQ9H019 292 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 AGTP01019 485 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 HLA-DRAP01903 254 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 COPS2P61201 443 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 AP1B1Q10567 949 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 MTF1Q14872 753 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 PKN1Q16512 942 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 TTC8Q8TAM2 541 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ATG4CQ96DT6 458 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 CHP1Q99653 195 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 SP110Q9HB58 689 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 CDH6P55285 790 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ACTR2P61160 394 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.325e-6■■■■□ 19.6
PDE4D-228ENST00000636120 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 DRP2Q13474 957 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 NOTUMQ6P988 496 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 SPAG6O75602 509 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 GUCY2CP25092 1073 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ACAD11Q709F0 780 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 IDI2Q9BXS1 227 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 PXMP2Q9NR77 195 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 GMNCA6NCL1 334 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 KBTBD13C9JR72 458 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 PSTPIP1O43586 416 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ARSEP51690 589 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ART3Q13508 389 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 C4orf19Q8IY42 314 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 POLD4Q9HCU8 107 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 LCP1P13796 627 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ACOT2P49753 483 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 HSD17B4P51659 736 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 VEPH1Q14D04 833 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ANO4Q32M45 955 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 USP49Q70CQ1 688 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 TMC2Q8TDI7 906 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ITGA4P13612 1032 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 TMPRSS15P98073 1019 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 SATB1Q01826 763 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 NME3Q13232 169 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 GIT2Q14161 759 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 TERF2Q15554 542 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 CCL15Q16663 113 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 HIF1AQ16665 826 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 P3H1Q32P28 736 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 AFG1LQ8WV93 481 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 BFARQ9NZS9 450 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 MED24O75448 989 aa6.82□□□□□ -1.32
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