RNA–Protein interactions for RNA: YPR117W

YPR117W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YPR117W, Length 7,470 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR117W	YPR117W	CTR3	Q06686	241 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	GAT3	Q07928	141 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	BZZ1	P38822	633 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MTQ1	P53944	314 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SOR2	Q07786	357 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	AFT2	Q08957	416 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	UTR1	P21373	530 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MRPL25	P23369	157 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	AIM24	P47127	394 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	PGU1	P47180	361 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	YDL109C	Q12103	647 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	APC9	Q12107	265 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SGE1	P33335	543 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SPC34	P36131	295 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	YIL060W	P40519	144 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MGA1	P53050	456 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	EKI1	Q03764	534 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	GTO3	Q04806	366 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	LDB18	Q07887	179 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	YLR111W	Q12528	110 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	UBA3	Q99344	299 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	VPS63	O13549	108 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	QDR3	P38227	689 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MBB1	P39534	108 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ATM1	P40416	690 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ATG17	Q06410	417 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	CSM4	Q08955	156 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	YOR114W	Q12219	294 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	RNH203	Q12338	110 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	COX2	P00410	251 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	VAR1	P02381	398 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	GIT1	P25346	518 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	BEM1	P29366	551 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	NTG1	P31378	399 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ACB1	P31787	87 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ACP1	P32463	125 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	NUP2	P32499	720 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SHG1	P38337	142 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	TAE1	P38340	232 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MIC12	P38341	106 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SEN34	P39707	275 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	RTS2	P40962	232 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SYS1	P41544	203 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	YGL114W	P53134	725 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	GET1	P53192	235 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	TIM21	P53220	239 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ARP10	Q04549	284 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	RBD2	Q12270	262 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	VHS2	P40463	436 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MDM34	P53083	459 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	BRP1	P53194	125 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	CDH1	P53197	566 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ASI3	P53983	676 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MRP51	Q02950	344 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	YDL218W	Q07629	317 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.81	□□□□□ -2.28	not detected
YPR117W	YPR117W	FMP16	Q12497	93 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SEY1	Q99287	776 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ITR2	P30606	609 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	SSO1	P32867	290 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	NUF2	P33895	451 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	YBR056W	P38081	501 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	FAU1	P40099	211 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	MOG1	P47123	218 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	RMR1	P53060	241 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	ROG1	P53118	685 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	CRZ1	P53968	678 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	DID2	P69771	204 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	YML018C	Q03730	393 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	YEH2	Q07950	538 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YPR117W	YPR117W	DTR1	P38125	572 aa		0.81	□□□□□ -2.28

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 81.6 ms