RNA–Protein interactions for RNA: YLR466W

YRF1-4, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeast

Gene YRF1-4, Length 4,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRF1-4	YLR466W	YNR048W	P53740	393 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	ISU1	Q03020	165 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YDR248C	Q03786	193 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YLR352W	Q06479	807 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	NDE2	Q07500	545 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	CHS7	P38843	316 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	BMT5	P40493	336 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	SCY1	P53009	804 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	TIM44	Q01852	431 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	OPI3	P05375	206 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	OTU1	P43558	301 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	MSY1	P48527	492 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YPL272C	Q08984	517 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	SWM1	Q12379	170 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	ERG4	P25340	473 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	PET18	P25362	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	PPZ2	P33329	710 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	ATG21	Q02887	496 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	MRP20	P32387	263 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	OM14	P38325	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	PIN2	Q12057	282 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	COS9	P36034	407 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	AVT4	P50944	713 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	SKP1	P52286	194 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	RNH201	P53942	307 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YOR385W	Q08909	290 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	VAM3	Q12241	283 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	IFM1	P25038	676 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	PKP2	P53170	491 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	DFG5	Q05031	458 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YPD1	Q07688	167 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YPL278C	Q08990	100 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	BUD25	P85052	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YDL180W	Q12301	547 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	FRE7	Q12333	620 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	MKS1	P34072	584 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YIP4	P53093	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	GIS1	Q03833	894 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	MED4	Q12343	284 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YCR061W	P25639	631 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	MOH1	P38191	138 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YIR035C	P40579	254 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	PGU1	P47180	361 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	AGE1	Q04412	482 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	GAS2	Q06135	555 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
YRF1-4	YLR466W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	PDC2	P32896	925 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	SOL3	P38858	249 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	BLM10	P43583	2143 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	UBC12	P52491	188 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	HEM25	Q07534	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	SCP1	Q08873	200 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	AEP3	Q12089	606 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	NFS1	P25374	497 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	MRPL39	P36533	70 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	UFD1	P53044	361 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YDR209C	Q03480	137 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	SPR28	Q04921	423 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	ZEO1	Q08245	113 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	MCH4	Q08268	501 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	UBA3	Q99344	299 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	FMP27	Q06179	2628 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	AAC1	P04710	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	POP8	P38208	133 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	GNP1	P48813	663 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YDR387C	Q04162	555 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YRF1-4	YLR466W	YIL060W	P40519	144 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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