RNA–Protein interactions for RNA: YLR423C

ATG17, Transcript of Scaffold protein responsible for phagophore assembly site organization, yeast

Gene ATG17, Length 1,254 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG17	YLR423C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	PST1	Q12355	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	COS2	P0CX12	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	COS3	P0CX13	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	COQ1	P18900	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	DRE2	P36152	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	FMT1	P32785	401 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	MAL32	P38158	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	TEM1	P38987	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	MRH4	P53166	561 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	MAL12	P53341	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	BNA7	Q04066	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	YMR31	P19955	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	SFC1	P33303	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	MRX4	Q12467	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG17	YLR423C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	SLX1	P38324	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	ECM14	P38836	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	YDL012C	Q12489	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	STE18	P18852	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	SSO1	P32867	290 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	CAB3	P36076	571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	CPR7	P47103	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	EMI1	Q04406	187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	YPR195C	Q06594	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	RNP1	P32385	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	YKL075C	P36083	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	RIB1	P38066	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	OST3	P48439	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	SEI1	Q06058	285 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	TIM22	Q12328	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	SEY1	Q99287	776 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	PRY2	P36110	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	SIP3	P38717	1229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	TRM9	P49957	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	CDC123	Q05791	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	HEM25	Q07534	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	NCB2	Q92317	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	SWI1	P09547	1314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	ERG28	P40030	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	YGL034C	P53186	121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG17	YLR423C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	ECM13	P38195	257 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	RAD17	P48581	401 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	SIR4	P11978	1358 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	SEC22	P22214	214 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	YER189W	P40104	122 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	YNL194C	P40169	301 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	MIC26	P50087	233 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	MDM34	P53083	459 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	YNL046W	P53956	172 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	PRM7	Q12459	698 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	RAD10	P06838	210 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	AGA2	P32781	87 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	MCM22	P47167	239 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	FYV6	P53913	173 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	GEP5	Q12393	293 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	HIS3	P06633	220 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	PPH21	P23594	369 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	ILM1	P47155	203 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	SNA3	P14359	133 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	ALG13	P53178	202 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ATG17	YLR423C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69

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