RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W COS1P53822 381 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W HXT11P54862 567 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data1.78□□□□□ -2.13not detected
SSQ1YLR369W YKR005CQ02203 525 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MMT1Q03218 510 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W DYN3Q04949 312 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W CTS2Q06350 511 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MDM36Q06820 579 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W BTS1Q12051 335 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MSH5Q12175 901 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa1.78□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MES1P00958 751 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W CLB3P24870 427 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YCR041WP37265 110 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W ATP3P38077 311 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YHR035WP38769 630 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W TRS85P46944 698 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W SSN8P47821 323 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YIP5P53108 310 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W GPI1P53306 609 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YPL077CQ02831 240 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W GMC1Q04399 608 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W PHO92Q06390 306 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W IRC19Q07843 230 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YOL131WQ08270 108 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W VIK1Q12045 647 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W JLP1Q12358 412 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YOR343CQ12484 108 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YOL159C-AQ3E769 90 aa1.77□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W GIT1P25346 518 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YCR007CP25354 239 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MIG1P27705 504 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W RRF1P38771 230 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W RCY1P39531 840 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W KRE29P40026 464 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W JLP2P40206 208 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YJL213WP40896 331 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W VMA10P48836 114 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MAL13P53338 473 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W COS6P53344 381 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YDR476CQ03362 224 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W IPK1Q06667 281 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W SGT1Q08446 395 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W RPL39P04650 51 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W PDE2P06776 526 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W GCN3P14741 305 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W PET9P18239 318 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W ERD2P18414 219 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W DBR1P24309 405 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W HSP30P25619 332 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W NTG1P31378 399 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W AFG1P32317 509 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W NUP2P32499 720 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W SIP2P34164 415 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W RCK1P38622 512 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YPI1P43587 155 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YGR149WP48236 432 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MRPL50P53724 139 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W CWC25P53854 179 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YDR102CQ03864 110 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W DCI1Q08558 271 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YLR053CQ12026 108 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W FCY22Q12119 530 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YOR214CQ12282 236 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W HMS1Q12398 434 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W IZH2Q12442 317 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W SNF8Q12483 233 aa1.76□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W ILV5P06168 395 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W SPS4P09937 338 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W NDC1P32500 655 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W GLC7P32598 312 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MRPL17P36528 281 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W POP7P38291 140 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W SSO2P39926 295 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W ISC1P40015 477 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W SNL1P40548 159 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MIG2P53035 382 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W CGR1P53188 120 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W RCF2P53721 224 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W YNR064CP53750 290 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W PET191Q02772 108 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W RRN5Q02983 363 aa1.75□□□□□ -2.13
SSQ1YLR369W TAZ1Q06510 381 aa1.75□□□□□ -2.13
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