RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPD1	YGR247W	ECM18	Q04623	453 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CPD1	YGR247W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CPD1	YGR247W	PRE4	P30657	266 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CPD1	YGR247W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CPD1	YGR247W	CUE1	P38428	203 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CPD1	YGR247W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CPD1	YGR247W	ASI2	P53895	289 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CPD1	YGR247W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CPD1	YGR247W	SOR2	Q07786	357 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CPD1	YGR247W	LOT6	Q07923	191 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CPD1	YGR247W	MIG1	P27705	504 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	VPS17	P32913	551 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	ZRT3	P34240	503 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	SDS22	P36047	338 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	FIN1	Q03898	291 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	EAF3	Q12432	401 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	IMP1	P28627	190 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	RPD3	P32561	433 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	SHE1	P38200	338 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	AIM46	P38885	310 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	NTA1	P40354	457 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	SLD3	P53135	668 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	OKP1	P53298	406 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	YLR345W	Q06137	509 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	PHO85	P17157	305 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	MDM31	P38880	579 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	SSN8	P47821	323 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	YMR087W	Q04299	284 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	UPS1	Q05776	175 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	RFM1	Q12192	310 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	ATR1	P13090	542 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	ENA1	P13587	1091 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	NDC1	P32500	655 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	PRE3	P38624	215 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	YRB2	P40517	327 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	MRX5	P47007	382 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	ENA2	Q01896	1091 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	YLR122C	Q12312	125 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	BBP1	Q12365	385 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	ENA5	Q12691	1091 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	MSN1	P22148	382 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	DOA4	P32571	926 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	SNL1	P40548	159 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	POP6	P53218	158 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	HUT1	Q12520	339 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	MKS1	P34072	584 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	ECM31	P38122	312 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	SDS24	P38314	527 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	FMP33	P46998	180 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	TTI2	P47168	421 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	YGL204C	P53089	101 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	SPG4	Q04438	115 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	YLR346C	Q06139	101 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	PEX30	Q06169	523 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	YLR173W	Q06247	608 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	YOR186W	Q08560	144 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CPD1	YGR247W	REP2	P03872	296 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	PEP12	P32854	288 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	RCN1	P36054	211 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	PAC2	P39937	518 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	FIP1	P45976	327 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	VAM3	Q12241	283 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	WHI5	Q12416	295 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	FRE6	Q12473	712 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	COX9	P07255	59 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	ATG22	P25568	528 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	DDI1	P40087	428 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	RPA43	P46669	326 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	PAU12	P53343	120 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	YOL114C	Q12322	202 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CPD1	YGR247W	YPR1	Q12458	312 aa		7.26	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.9 ms