RNA–Protein interactions for RNA: YFR055W

IRC7, Transcript of Beta-lyase involved in the production of thiols, yeast

Gene IRC7, Length 1,023 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRC7	YFR055W	HSP30	P25619	332 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	IES6	P32617	166 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	SPC34	P36131	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YNL320W	P42840	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	GPI8	P49018	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	MSS11	Q03825	758 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YFH1	Q07540	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	ATX2	Q12067	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	MRX4	Q12467	430 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	CUE1	P38428	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	TOS2	P50078	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	UFD1	P53044	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
IRC7	YFR055W	SAM50	P53969	484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	HMS1	Q12398	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	AUA1	P32450	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	VPS17	P32913	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	ECM15	P35195	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	YBR096W	P38256	230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	TRS85	P46944	698 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	COQ10	Q08058	207 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	MDM10	P18409	493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	PHO91	P27514	894 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	TRS65	P32893	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	RIM2	P38127	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	YBR241C	P38142	488 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	PCL6	P40038	420 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	SML1	Q04964	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	EXO70	P19658	623 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	ECM25	P32525	599 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
IRC7	YFR055W	RRF1	P38771	230 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	JLP1	Q12358	412 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	SNF8	Q12483	233 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	CMK2	P22517	447 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	TCA17	P32613	152 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	MSN4	P33749	630 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	FLX1	P40464	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	FIP1	P45976	327 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	RPA43	P46669	326 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	AVT4	P50944	713 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	WSC2	P53832	503 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	MGR3	Q04472	501 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	SYO1	Q07395	620 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	MCT1	Q12283	360 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IRC7	YFR055W	MER1	P16523	270 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	YPK2	P18961	677 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	TIM12	P32830	109 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	FRE2	P36033	711 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	SNM1	P40993	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	GAB1	P41733	394 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	HMS2	P47175	358 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	BRR6	P53062	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	YEH2	Q07950	538 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	MRPS28	P21771	286 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	SUR1	P33300	382 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	PTC1	P35182	281 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	QDR3	P38227	689 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	BIG1	P38813	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	EFM3	P47163	339 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	YIP1	P53039	248 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	JEN1	P36035	616 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	GPI15	P53961	229 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IRC7	YFR055W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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