RNA–Protein interactions for RNA: YDL079C

MRK1, Transcript of Glycogen synthase kinase 3 (GSK-3) homolog, yeast

Gene MRK1, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRK1	YDL079C	RNH201	P53942	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SPO19	Q03029	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	ORT1	Q12375	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	NKP1	Q12493	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	APA2	P22108	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	HXT2	P23585	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SNC2	P33328	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YOX1	P34161	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YND1	P40009	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	PCL6	P40038	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	GRX3	Q03835	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SPR28	Q04921	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	ATG17	Q06410	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	TPO3	Q06451	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	HEM25	Q07534	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	CSI2	Q08054	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	QCR7	P00128	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SPS4	P09937	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	MSS4	P38994	779 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RMD6	P39975	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YHC3	P47040	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	TAF4	P50105	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	DOC1	P53068	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	GEP7	P53171	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	IMO32	P53219	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	PIN3	Q06449	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	GCN4	P03069	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
MRK1	YDL079C	NAT2	P37293	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SLM1	P40485	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	BUD8	P41698	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YNR064C	P53750	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	GPN3	Q06543	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	FCY22	Q12119	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YLR358C	O13565	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RPB9	P27999	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	FMP23	P38231	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	CCZ1	P38273	704 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	OSH7	P38755	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	GON7	P46984	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RCF1	Q03713	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	MDM36	Q06820	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	HUT1	Q12520	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	HIS3	P06633	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	MRPS28	P21771	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	CNE1	P27825	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	VMA11	P32842	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YBR137W	P38276	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	UMP1	P38293	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RTT105	P40063	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SSN8	P47821	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	GRC3	Q07845	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	EAF3	Q12432	401 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	CCW14	O13547	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	REP2	P03872	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	PET18	P25362	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	MTC7	P32633	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	GPI18	P38211	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	LNP1	P38878	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	IES5	P40060	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	UFD1	P53044	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	MRH4	P53166	561 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	CTF19	Q02732	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	TDA1	Q03533	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	MGR3	Q04472	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	IRC25	Q07951	179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	DYN1	P36022	4092 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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