RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RASA4O43374 803 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SLC37A4O43826 429 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 APOEP02649 317 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 HOXC6P09630 235 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PNPLA4P41247 253 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 LIG3P49916 1009 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RASSF3Q86WH2 238 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC7Q99615 494 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TBX20Q9UMR3 447 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MRC1P22897 1456 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TADA3O75528 432 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GYPCP04921 128 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CYP11B2P19099 503 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ADORA2BP29275 332 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 BCAR1P56945 870 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PPARDQ03181 441 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 KRT17Q04695 432 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM143Q96AN5 459 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 EHD2Q9NZN4 543 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP69A5D8W1 941 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CLTAP09496 248 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ITIH2P19823 946 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GPS1Q13098 491 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PSMD6Q15008 389 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SNX17Q15036 470 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NTRK3Q16288 839 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 IL17RAQ96F46 866 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MROH8Q9H579 483 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 KIF3CO14782 793 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 OAZ1P54368 228 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 LAMB3Q13751 1172 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 HPS3Q969F9 1004 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GBP5Q96PP8 586 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 THEGQ9P2T0 379 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 BAG2O95816 211 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NAMPTP43490 491 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SULT1E1P49888 294 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GALCP54803 685 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 DNERQ8NFT8 737 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 COG1Q8WTW3 980 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 EPAS1Q99814 870 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MRIQ9BWK5 157 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CACNA1FO60840 1977 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NFAT5O94916 1531 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SKIP12755 728 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SLC26A2P50443 739 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NPEPPSP55786 919 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 BACE1P56817 501 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 EFHBQ8N7U6 833 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 KRT35Q92764 455 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CREB3O43889 395 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 HSPA4LO95757 839 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 GARTP22102 1010 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 RCN2Q14257 317 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL29Q96CT2 875 aa6.84□□□□□ -1.32
PDE4D-228ENST00000636120 WDR24Q96S15 920 aa6.84□□□□□ -1.32
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