RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P IES6P32617 166 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MTC7P32633 139 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL102CP34249 101 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P AST1P35183 429 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SDS22P36047 338 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YPK3P38070 525 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P TAT1P38085 619 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ICS2P38284 255 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YND1P40009 630 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PUG1P40100 303 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P DLS1P40366 167 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P AGE2P40529 298 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P GZF3P42944 551 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P GON7P46984 123 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FMP33P46998 180 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P AVT4P50944 713 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MTL1P53214 551 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P AAH1P53909 347 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P NRK1P53915 240 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SAM50P53969 484 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ENA2Q01896 1091 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P NOG1Q02892 647 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR248CQ03786 193 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P DLT1Q04216 342 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR283WQ05867 314 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR098CQ06089 161 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR345WQ06137 509 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR346CQ06139 101 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ASR1Q06834 288 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P GSH2Q08220 491 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ISA2Q12425 185 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P EAF3Q12432 401 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ENA5Q12691 1091 aa2.19□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SOD2P00447 233 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO4P07270 312 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SAG1P20840 650 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FUN26P31381 517 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ACH1P32316 526 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PRP21P32524 280 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P REC114P32841 428 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YOX1P34161 385 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MTH1P35198 433 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM4P36156 370 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YCR041WP37265 110 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P NAT2P37293 288 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P GPI18P38211 433 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ARC40P38328 384 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SSH1P38353 490 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P OSH7P38755 437 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PMT6P42934 759 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PIR5P46999 287 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR120WP47157 116 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P TAF4P50105 388 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL159WP53110 370 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MRH4P53166 561 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YKR005CQ02203 525 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SPC19Q03954 165 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P GAL83Q04739 417 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR252CQ04814 134 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MRX10Q05648 414 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FRE3Q08905 711 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P FCY1Q12178 158 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P RFM1Q12192 310 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR1Q12458 312 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR161W-CQ3E744 92 aa2.18□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P GCD1P09032 578 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YER190C-BP0CX94 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YEL077W-AP0CX95 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR296C-BP0CX96 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL283W-BP0CX97 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR204C-AP0CX98 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YFL068WP0CX99 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YLL066W-AP0CY00 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YLL067W-AP0CY01 160 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ATP10P18496 279 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P IDP1P21954 428 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P DAL3P32459 195 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ECT1P33412 323 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P MTC2P34246 357 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P TMA19P35691 167 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P RCN1P36054 211 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P THI2P38141 450 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ALG14P38242 237 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P LNP1P38878 278 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P AIM46P38885 310 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PSD1P39006 500 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM1P39715 212 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P NTA1P40354 457 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SNL1P40548 159 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YFL015CP43578 164 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P CCC1P47818 322 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PUS4P48567 403 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P LYS20P48570 428 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P PMT5P52867 743 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL114WP53134 725 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P SCW11P53189 542 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P POP6P53218 158 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR152CP54072 576 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)PtW(CCA)P HHT1P61830 136 aa2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.6 ms