RNA–Protein interactions for RNA: YOR259C

RPT4, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT4	YOR259C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	GIM3	P53900	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ARL3	Q02804	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	GUP2	Q08929	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MED4	Q12343	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	TFC7	Q12415	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MSB2	P32334	1306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MDM35	O60200	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PBN1	P25580	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	DOA1	P36037	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MAL32	P38158	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YBR184W	P38299	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
RPT4	YOR259C	POG1	P40473	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ICE2	P40499	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	EMC5	P40540	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YIR035C	P40579	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ZIM17	P42844	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SFH5	P47008	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SRB7	P47822	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YGL117W	P53133	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YGR012W	P53206	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PEF1	P53238	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	OKP1	P53298	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MAL12	P53341	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	BUD25	P85052	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SPC19	Q03954	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SNO4	Q04902	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	HSP32	Q08992	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	CBS1	P14066	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PPH21	P23594	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	IFM1	P25038	676 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MSK1	P32048	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RPD3	P32561	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MDL1	P33310	695 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ECM15	P35195	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SEN34	P39707	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YER158C	P40095	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PUG1	P40100	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YIL060W	P40519	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MNT3	P40549	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	OTU1	P43558	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SWS2	P53937	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PEX25	Q02969	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ROY1	Q04847	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YML053C	Q04978	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MDM30	Q05930	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	TMA10	Q06177	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YFT2	Q06676	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	FDH1	Q08911	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	GAL4	P04386	881 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YPK2	P18961	677 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RPB5	P20434	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MSN4	P33749	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
RPT4	YOR259C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YAL037W	P39728	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	VPS52	P39904	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	VMA21	P41806	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	AGX1	P43567	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	CIN2	P46670	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	UBP8	P50102	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MEH1	Q02205	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	NNT1	Q05874	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	AIM6	Q07716	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ODC2	Q99297	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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