RNA–Protein interactions for RNA: YKL034W

TUL1, Transcript of Subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene TUL1, Length 2,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TUL1	YKL034W	YJR012C	P47087	207 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	SWS2	P53937	143 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	GPI17	Q04080	534 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	NUP1	P20676	1076 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	ZRT1	P32804	376 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	ROT2	P38138	954 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	MDM31	P38880	579 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	YIL029C	P40538	142 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	YGR017W	P53210	297 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	HEM25	Q07534	307 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	COQ10	Q08058	207 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	EDE1	P34216	1381 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TUL1	YKL034W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	TYR1	P20049	452 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MRP49	P32388	137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	FRE2	P36033	711 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	FAU1	P40099	211 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	EGT2	P42835	1041 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	ASI3	P53983	676 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SFH1	Q06168	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	IRC13	Q08630	104 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SCP1	Q08873	200 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	TSC11	P40061	1430 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	ERD1	P16151	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CDC50	P25656	391 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	BUB3	P26449	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	COS8	P38723	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YHR035W	P38769	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	RPP1	P38786	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	AIM18	P38884	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SER33	P40510	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	GMC1	Q04399	608 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YML053C	Q04978	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SUT2	Q12286	268 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	TFS1	P14306	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MDM10	P18409	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	TRR2	P38816	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	ERV46	P39727	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SER2	P42941	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SOL1	P50278	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	FRE4	P53746	719 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	RSC9	Q03124	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SDH7	Q04401	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MED7	Q08278	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	OSW1	Q08692	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SRL2	Q12020	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	HRT3	Q12347	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	KAE1	P36132	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YBR062C	P38239	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	EXO1	P39875	702 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CTH1	P47976	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CAF40	P53829	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CLB2	P24869	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	INO2	P26798	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	PEX7	P39108	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	GLE2	P40066	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MCM22	P47167	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YIP1	P53039	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MRPL3	P36516	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	VMA7	P39111	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	AIM23	P47015	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YJR015W	P47090	510 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	UBC13	P52490	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	TRM12	Q04235	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	ATG39	Q06159	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 101.4 ms