RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	YPD1	Q07688	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YOR1	YGR281W	YHK8	P38776	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	DFG16	Q99234	619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CYT1	P07143	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YOR1	YGR281W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SPT14	P32363	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RPB11	P38902	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PEX7	P39108	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CAT5	P41735	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MCM22	P47167	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PEF1	P53238	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MSS11	Q03825	758 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RSM24	Q03976	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	GAS2	Q06135	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RFU1	Q08003	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	FRE6	Q12473	712 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MRP20	P32387	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MSY1	P48527	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ORM1	P53224	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	NCE101	Q02820	53 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	REH1	Q06709	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	DAP1	Q12091	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	TAO3	P40468	2376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	STE18	P18852	110 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	PMT2	P31382	759 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	STE14	P32584	239 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	BXI1	P48558	297 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	PET191	Q02772	108 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	RRG8	Q06109	277 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	PFA4	Q12006	378 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	REP2	P03872	296 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	PHO85	P17157	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	CPR2	P23285	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	PRE4	P30657	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	HMX1	P32339	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	ERG25	P53045	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	AAT1	Q01802	451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	CNE1	P27825	502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	UMP1	P38293	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	POG1	P40473	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	TIS11	P47977	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	REC102	Q02721	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	GIS1	Q03833	894 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	NDE2	Q07500	545 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	RSC58	Q07979	502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	GSH1	P32477	678 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	FRM2	P37261	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	HXT16	P47185	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	MDM30	Q05930	598 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	RML2	P32611	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	KAE1	P36132	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	MKC7	P53379	596 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	SUR7	P54003	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	SDC1	Q03323	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	YML079W	Q03629	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	ERG4	P25340	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	EHD3	P28817	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	YJR120W	P47157	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	DAD3	P69850	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	SDH7	Q04401	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	RLM1	Q12224	676 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YOR1	YGR281W	YRM1	Q12340	786 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 124.6 ms