RNA–Protein interactions for RNA: YFR055W

IRC7, Transcript of Beta-lyase involved in the production of thiols, yeast

Gene IRC7, Length 1,023 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRC7	YFR055W	CTS2	Q06350	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	TIM9	O74700	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	RHB1	P25378	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	SEC17	P32602	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	ATF1	P40353	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	HXT11	P54862	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	CRC1	Q12289	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC7	YFR055W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	GPX1	P36014	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	PHD1	P36093	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	PHO89	P38361	574 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	INA22	P40576	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	MDE1	P47095	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	NAS6	P50086	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YIP5	P53108	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	SLM2	P53955	656 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	VPS60	Q03390	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	PDE2	P06776	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	NAM2	P11325	894 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	GIT1	P25346	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	GPI18	P38211	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YIL024C	P40543	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	IZH2	Q12442	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	SCEI	P03882	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	PMR1	P13586	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YPK3	P38070	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	RFC3	P38629	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	ECM34	P38728	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	CTR2	P38865	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	MLH1	P38920	769 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	RCY1	P39531	840 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	GPI1	P53306	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	COS6	P53344	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YNL181W	P53878	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	IZH1	Q03419	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	FMN1	Q03778	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	HSP31	Q04432	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	PHO92	Q06390	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	APC9	Q12107	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YEL043W	P32618	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	CAF4	P36130	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	MRPL4	P36517	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	KRE29	P40026	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	IAH1	P41734	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	GEP7	P53171	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	BIO4	P53630	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	SOR2	Q07786	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	IRC25	Q07951	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	BTS1	Q12051	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	ERD2	P18414	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	MRPL25	P23369	157 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YCR007C	P25354	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	NUP2	P32499	720 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
IRC7	YFR055W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	NAS2	P40555	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	RTS2	P40962	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	SAS2	P40963	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	DSL1	P53847	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	VTI1	Q04338	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	ARV1	Q06541	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	GSH2	Q08220	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	RPL39	P04650	51 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	ACH1	P32316	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YHR035W	P38769	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	RCF2	P53721	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	MFG1	Q07684	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRC7	YFR055W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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