RNA–Protein interactions for RNA: YDL135C

RDI1, Transcript of Rho GDP dissociation inhibitor, yeast

Gene RDI1, Length 609 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RDI1	YDL135C	PHO13	P19881	312 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	COX10	P21592	462 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	VPS3	P23643	1011 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YKL063C	P35725	167 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	GPX1	P36014	167 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	PEX18	P38855	283 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	COQ5	P49017	307 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	KEL2	P50090	882 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	FLC3	P53121	802 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	ECM19	Q06011	112 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YDL012C	Q12489	107 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	LAG2	Q92325	660 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	RPB9	P27999	122 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	RPC37	P36121	282 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	UFE1	P41834	346 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	FMP33	P46998	180 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	ARO80	Q04052	950 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	TKL2	P33315	681 aa		3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	COY1	P34237	679 aa		3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	TPO5	P36029	618 aa		3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	MED6	P38782	295 aa		3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	RPN14	P53196	417 aa		3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	TIM13	P53299	105 aa		3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	GPM2	Q12008	311 aa		3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	POM33	Q12164	279 aa		3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	TFC7	Q12415	435 aa		3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YPR064W	Q12492	139 aa		3	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	JIP3	O13555	125 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	PEX34	P25584	144 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	PEX30	Q06169	523 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	GPN3	Q06543	272 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	VIK1	Q12045	647 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YDL211C	Q12121	372 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	TRM10	Q12400	293 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	GIS3	Q12418	502 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	TFS1	P14306	219 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YSR3	P23501	404 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	IFM1	P25038	676 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YCR025C	P25352	136 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	ZIP1	P31111	875 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	MRPL37	P36532	105 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	FRM2	P37261	193 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	TCD1	P38756	429 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	TDA11	P38854	504 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	BDH1	P39714	382 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YIL054W	P40524	105 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	MIC19	P43594	170 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YGL118C	P53132	145 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	MRX8	Q05473	314 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YPL278C	Q08990	100 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	RAD10	P06838	210 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	MEI4	P29467	408 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	HMT1	P38074	348 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	FRT2	P39734	528 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	KAP114	P53067	1004 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	SPP2	Q02521	185 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	TAF9	Q05027	157 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	YLR462W	O13556	202 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	YHL049C	P38722	271 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	MOB1	P40484	314 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	YFL064C	P43540	174 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	SNZ3	P43545	298 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	EMC4	P53073	190 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	HST4	P53688	370 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	SNZ2	P53824	298 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.96	□□□□□ -1.94	not detected
RDI1	YDL135C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	SML1	Q04964	104 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	DPP1	Q05521	289 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	YLL007C	Q07799	665 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	YOR114W	Q12219	294 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	CBF1	P17106	351 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	DAL81	P21657	970 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	MGT1	P26188	188 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	AEP1	P32493	518 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RDI1	YDL135C	SRB4	P32569	687 aa		2.95	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 86.4 ms