RNA–Protein interactions for RNA: YDL079C

MRK1, Transcript of Glycogen synthase kinase 3 (GSK-3) homolog, yeast

Gene MRK1, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRK1	YDL079C	MRX10	Q05648	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	FRE3	Q08905	711 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	TGS1	Q12052	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	FSH3	Q99369	266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	COX9	P07255	59 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	MSI1	P13712	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	PAU24	P38155	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	GOS1	P38736	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	TYW3	P53177	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	PEF1	P53238	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	SLI1	P53304	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YNL046W	P53956	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YDC1	Q02896	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	MSS11	Q03825	758 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	RBD2	Q12270	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	PAM16	P42949	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YGL204C	P53089	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	MAK3	Q03503	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	DLT1	Q04216	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	HLR1	Q04429	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	RTR2	Q12378	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	AHC2	P25649	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	DOA4	P32571	926 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	REC114	P32841	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	SDS24	P38314	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YIR020C	P40575	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	CIN2	P46670	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	NCA3	P46955	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	PHB2	P50085	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YGL159W	P53110	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	GMC1	Q04399	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	SNA4	Q07549	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	REP1	P03871	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	RPL39	P04650	51 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	AFG1	P32317	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	MKS1	P34072	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	MTH1	P35198	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	DDI1	P40087	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	EFM3	P47163	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	PMT5	P52867	743 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YIP4	P53093	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	PEX30	Q06169	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	SSK1	Q07084	712 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	RFU1	Q08003	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRK1	YDL079C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SAG1	P20840	650 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	ARO7	P32178	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	PPZ2	P33329	710 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RCN1	P36054	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YJR120W	P47157	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	AVT4	P50944	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	POP6	P53218	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	ASR1	Q06834	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	FRE8	Q12209	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	ERP4	Q12450	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SIR2	P06700	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SGA1	P08019	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	PAU2	P32612	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	ZRT3	P34240	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SFK1	P35735	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	CTR2	P38865	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
MRK1	YDL079C	BNA2	P47125	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	ABM1	P47146	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRK1	YDL079C	SCW11	P53189	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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