RNA–Protein interactions for RNA: YBL093C

ROX3, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene ROX3, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROX3	YBL093C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	BOS1	P25385	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RAD51	P25454	400 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	VPS17	P32913	551 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YBR137W	P38276	179 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	OM14	P38325	134 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YER184C	P39961	794 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PKP1	P40530	394 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	ATG18	P43601	500 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RPE1	P46969	238 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SAY1	P53324	424 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PFA5	Q03289	374 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RSM28	Q03430	361 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	TDA1	Q03533	586 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	COX20	Q04935	205 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	TRI1	Q05024	226 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	HOF1	Q05080	669 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	IRC19	Q07843	230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RAX1	Q08760	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SFG1	Q12507	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	AAC1	P04710	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	HIS3	P06633	220 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PPA2	P28239	310 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PAU2	P32612	120 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RPC34	P32910	317 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SRL3	P36167	246 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PEX32	P38292	413 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YER010C	P40011	234 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	IRC18	P47056	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	CCC1	P47818	322 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	BRR6	P53062	197 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YGL204C	P53089	101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	ERV29	P53337	310 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	GRE1	Q08969	168 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	ATG41	Q12048	136 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	BAG7	Q12128	409 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	CAP2	P13517	287 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	CTA1	P15202	515 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MDM10	P18409	493 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	STE50	P25344	346 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	RCN1	P36054	211 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
ROX3	YBL093C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
ROX3	YBL093C	YFL015C	P43578	164 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	BNA6	P43619	295 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	DOC1	P53068	250 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	TPN1	P53099	579 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YGR126W	P53274	230 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	BNA7	Q04066	261 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PHO92	Q06390	306 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	TPO3	Q06451	622 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	GCN4	P03069	281 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	CPR2	P23285	205 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ERG8	P24521	451 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	LDB16	P25587	256 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	CPR3	P25719	182 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ACH1	P32316	526 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MCM10	P32354	571 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	PDR3	P33200	976 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SFK1	P35735	353 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	COS9	P36034	407 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	HOT13	P36078	116 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SDS24	P38314	527 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	SER3	P40054	469 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YKE4	P40544	346 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	NUP53	Q03790	475 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	MIM1	Q08176	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ROX3	YBL093C	HMS1	Q12398	434 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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