RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SNX24Q9Y343 169 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 COPEO14579 308 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SPDYE6P0CI01 402 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 STK4Q13043 487 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SEPT6Q14141 434 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM5Q71RC9 77 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINI1Q99574 410 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 HINFPQ9BQA5 517 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MSH4O15457 936 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CYP26A1O43174 497 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NCK2O43639 380 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CHEK2O96017 543 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ACADSBP45954 432 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CDK17Q00537 523 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GRB10Q13322 594 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 C4orf22Q6V702 233 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TC2NQ8N9U0 490 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 APPL2Q8NEU8 664 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ATL2Q8NHH9 583 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TOM1L1O75674 476 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ACSL3O95573 720 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CPT1AP50416 773 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PPP2R2AP63151 447 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SV2CQ496J9 727 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 JADE1Q6IE81 842 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FAM83AQ86UY5 434 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MED15Q96RN5 788 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM15Q9C019 465 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TBK1Q9UHD2 729 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TMX2Q9Y320 296 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RALAP11233 206 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CYP2C19P33261 490 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SLCO1A2P46721 670 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 EPHB1P54762 984 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NCOA4Q13772 614 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 IFT43Q96FT9 208 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ATRNO75882 1429 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MMEP08473 750 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINB6P35237 376 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GGCXP38435 758 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GTF2A2P52657 109 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CEP120Q8N960 986 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SENP1Q9P0U3 644 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TXNDC9O14530 226 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TRAPPC3O43617 180 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PMLP29590 882 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CENPCQ03188 943 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SREBF2Q12772 1141 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MYBPC2Q14324 1141 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 STAT4Q14765 748 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 DGKDQ16760 1214 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CD302Q8IX05 232 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FSCBQ5H9T9 825 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FIGNQ5HY92 759 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GDAP1Q8TB36 358 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SCFD2Q8WU76 684 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 C18orf8Q96DM3 657 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 BAG5Q9UL15 447 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RASA4BC9J798 803 aa6.85□□□□□ -1.31
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